2007年2月6日，布什总统公布了建立一统一战司令部负责非洲陆的计划（埃及除外，因埃及被保留在中央司令部的管辖范围）。国研究处的一份研究认，新的非洲司令部“所产生，部分原因是国防部将非洲职责分配给3区域司令部的担忧，据说分配带协调方面的挑战”。除此外，据说伊拉克战争阿富汗战争欧洲中央司令部提了高的求。
非洲司令部2007年10月1日立，是欧洲司令部的一级司令部，2008年10月1日变了完整运的司令部。根据其任务描述，“（司令部）与跨国机构国际伙伴合，应危机，阻止打击跨国威胁，展国的国利益，促进区的安全、稳定繁荣。”2014年3月，非洲司令部司令官在参议院军委员证，确认了该司令部的“务急”是打击暴力极端主义增强东非的稳定，打击暴力极端主义增强北非、西非的稳定，保卫国公民设施的安全，增强几内亚湾的稳定，打击圣主抵抗军。
非洲司令部总部位德国斯图加特的凯利军营，由非洲司令部负责的数国前由欧洲司令部负责，因数负责非洲务的人员驻扎在斯图加特，有一原因是，非洲领导人不接受在非洲建立司令部。约有2000人被派往司令部，包括军人、联邦文职雇员承包商人员。他中有1500人在总部工。其项目通设置在约38国的安全合办公室武官办公室进行协调。司令部联络官员有驻扎在位埃塞俄比亚的非洲联盟总部、位尼日利亚的西非国经济共同体总部位加纳的科菲安南国际维部队培训中。
非洲司令部的员司令部包括了总部在意利维琴察的国非洲集团军位意利那不勒斯的国海军非洲部队。海军部队的主任务是提升海安全力非洲伙伴的力。有两军机构位斯图加特的国空军非洲部队国海军陆战队非洲部队。最两员司令部是有2000人的非洲角联合特遣部队，其总部位吉布提的雷蒙尼营，及位斯图加特的国特战司令部所属的非洲特战司令部。
情报知识展处（Intelligend Knowledge Development Directorate, J2）是非洲司令部总部的机构，组织结构图6.1所示。其总部位斯图加特，分部分别位英国的莫尔斯沃思、佛罗达州坦帕华盛顿特区。该处“执行情报行动；非洲司令部总部、属机构特定的伙伴机构管理情报搜集、分析、编制、分知识展”。有200人被派往位斯图加特的J2，253人被派往莫尔斯沃思。欧洲司令部的联合情报中位此（直其迁往克劳登皇空军基，预期将2016年始联合情报中的建设）。坦帕分部显是与国特战司令部的情报中协工。