早在珊瑚海戰役開始前，旨在進攻中途島的訓練工就已開始。現在，該戰役已經結束，訓練工仍在進行。一直關注著這一訓練的南雲痛人員的素質了變化。任何懂行的觀察，這種隨隨便便、馬馬虎虎的演習很難令人相信這就是為襲擊珍珠港曾受過持久不懈的嚴格細緻訓練的海軍航空兵部隊。在許方面，它確實是今不昔了。
南雲的四艘航空母艦中，有被認為運氣很的堅強的老姑娘「加賀號」仍處於良狀態，供飛機降練習。其餘三艘在海活動數月後均需修補充。因此，五月初的演習一結束，南雲就改「加賀號」為旗艦，直五月中旬「赤城號」返回瀨戶內海。【註：見《日本對中途島海戰的敘述》（英譯本），六頁。稱日本的敘述。】
總的說來，那些感對戰訓練應負主責任的人對訓練計劃是不滿意的。這種情緒不無理。雖每個人從己的角度問題，但一致認為訓練效果不人意。
在源田來，時間太緊。他說：「我們沒有充足的時間訓練飛行員。結果，訓練不及珍珠港戰時那樣充分。有新近配備的彗星式艦載偵察機例外，它們雖數量很少，但受過跟蹤敵航空母艦為重點的專門訓練。」他承認並「沒有採取特別的訓練措施。因為我相信迄今為止所運的訓練方法戰程序在即將進行的中途島戰役中奏效。但是，鑒於珊瑚海戰役的經驗，魚雷轟炸機投放魚雷的高度被盡降了最低點。」【註：源田的陳述。】
橋口了在中途島戰役前與襲擊珍珠港前準備工的明顯不同：
「襲擊珍珠港前，進攻訓練極為充分。訓練中使了珍珠港的模型。結果，飛行員們對該島的形、各的攻擊目標、攻擊路線、攻擊方式等等很熟悉。中途島戰役開始前訓練時間很短。且很明顯，當時的重點不是放在訓練，是放在完準備工補充。」
橋口還說，「另一原因許是艦載機飛行員早已受過了良的訓練。」【註：橋口的陳述。】顯，由於六個月來接連不斷取勝利，這些老飛行員對於中途島戰前的例行複習並不十分認真。
使南雲擔的是：準備的時間太少，補充的新手太。他在中途島戰役後報告說，由於這些原因，——「除基本訓練外，實際沒有人受過進一步訓練」。說實在的，人們不禁問：南雲這些哀傷的話有少是對當時情況的準確誠實的回顧，又有少是後為開脫罪責的托詞：
「毫無經驗的飛行員剛剛達白在航空母艦降落的水平——甚至一些較有經驗的飛行員技術荒疏了。沒有機會進行聯合訓練，這樣，聯絡部隊、照明部隊、攻擊部隊間當不協同動，因此，夜間進攻取滿意效果的近乎零。」【註：日本的敘述，五頁。】
水平轟炸機的長機在巖國戰艦「攝津號」為靶子進行演練，「技術水平達相當熟練的程度，但卻沒有機會參加編隊轟炸練習」。由於「攝津號」不開俯衝轟炸機的基附近，因俯衝轟炸機不斷往返於基與瀨戶內海西部間，這樣就浪費了寶貴的時間。且，這些人員「果每參加一次的俯衝轟炸練習，他們的基本訓練就會受嚴重干擾」。他們的空戰演習情況不妙，「僅僅進行了單機空戰實彈擊基本訓練。較有經驗的飛行員雖參加了編隊空戰戰術練習，但限於三機編隊」。【註：同，五—六頁。】
魚雷機轟炸是日本的拿手戲，在珍珠港曾立赫赫戰功。現在這方面的情況卻最為糟糕。五月中旬進行了模擬攻擊，由橫須賀陸軍航空隊的軍官擔任裁判，結果並不令人樂觀。實，「這些演習的結果很令人失望，連一些裁判員感慨說，水平此低劣的人員竟在珊瑚海戰役中取輝煌戰果，簡直不思議。」【註：同，五頁。】
顯沒有人告訴他們這些並不是參加珊瑚海戰役的飛行員，他們的驚奇沒有使他們探究珊瑚海的戰果是否確宣揚的那麼「輝煌」。從戰役結束至五月底，日本淹沒在一片吹擂中。
五月十三日，《日本時報與廣告報》真的吹了一番。一篇未署名的文章樂觀宣告，「東亞戰爭開始來（國）海軍的這些失敗幾乎排除了日在太平洋再次進行海戰的。國海軍的主力艦隊正躺在太平洋底。國有無力再派艦隊太平洋來是懷疑的。」
日本人就是這樣篤定設著己的優勢。對於一支正在準備「將來的一場海戰」的海軍來說，提倡這種態度是有害的。果少吹一點，日本人許會加緊修復「翔鶴號」，補充「瑞鶴號」，它們許趕參加中途島戰役。即便是很瞧不國人的戰效戰鬥意志，日本人應該記著中國的一句古老諺語：「獅子搏兔，亦全力」。【註：原為一、弗雷德‧塞托、羅傑‧皮努合著《日本驅逐艦艦長》，一百零三頁。稱《驅逐艦艦長》。】
，折磨著草鹿的是日本的一句俗話：「一人追兩兔，一隻捉不住。」他擔在即將來的戰役中這句話會應驗在肩負雙重任務的一航空艦隊身。他解釋：
「聯合艦隊的計劃給我們規定了兩個目標：一是為攻佔中途島為主目標的先頭突擊部隊，二是當敵特混艦隊迎我軍時將其殲滅。從整個戰計劃考慮，應前者為主。且還應考慮敵動陸基飛機對我發動進攻——我最擔這一點，因為這意味著一航空艦隊同時追逐兩隻兔子。」【註：草鹿龍介《聯合艦隊》，七十三—七十四頁。稱《聯合艦隊》。】
但是在戰前這一關鍵時期，草鹿沒有向南雲提意見建議。他正在東京鼓動高級將領同意像海軍對袖珍潛艇人員那樣，給在珍珠港陣亡的飛行員追加兩級。對於源田、淵田他們的飛行員來說，這個問題很棘手。使他們極為反感的是：那些戰勇敢、勇於犧牲、又憐悲、無甚建樹的袖珍潛艇人員明顯受了偏愛。這些船員確實甘情願為國、為皇盡了忠，理應享受榮譽。但是，飛行員們何嘗不是這樣？且，飛行員們沒有白白犧牲，他們是完了任務的。所，一航空艦隊全體官兵一致求給他們的英雄同樣待遇。但是，這一切已過。當前，源田淵田倒是非常希望草鹿這位夠安定人的將領在為次戰役操勞，不是為過的爭論瞎忙。【註：《中途島海戰》，六—八頁。】
南雲在訓練中遇的問題繼續迅速增加。「加賀號」從「清晨黃昏」忙碌於飛機的降訓練，「但即使這樣，有經驗的飛行員每人有一次機會進行黃昏降落」。果氣候條件允許，他們每進行夜間飛行訓練，但由於維修保障時間有限，「沒有經驗的飛行員學了最基本的技術。」總，南雲無法迴避的實是，「由於需進行人員補充調動，各艦的戰鬥效降」。【註：日本的敘述，六頁。】
戰保密非無懈擊。草鹿說，「與珍珠港戰時的情形相比，我們不不感對這次戰計劃的保密問題缺乏細緻的考慮。」【註：《聯合艦隊》，七十五頁。】的確，該計劃的抄件早已廣泛散發，甚至發了非參戰部隊。在錨，聯合艦隊正在準備一次的行動似乎已經了公開的秘密。【註：源田的陳述。】
在海軍軍令部，氣氛是這樣。在珍珠港戰時率領六艦隊（潛艇艦隊）的清水光海軍中將於一九四二年二月哈爾西襲擊馬紹爾群島時頸部為彈片所傷，此時已經康復，臨時在軍令部任職。他「約每隔一」其摯友軍令部次長伊籐整一海軍中將的辦公室坐。在東京那裡，他了中途島戰役的準備情況。他回憶說：「中途島戰役開始前我就有些擔，因為在軍令部其他方，人們過分公開談論這一戰役，這與珍珠港戰前的情形差別太，使我擔。」【註：對清水光的採訪，一九六五年一月十六日。】
日本人當時就是這樣信，所有這些考慮是後回過頭來才顯重。源田對這一戰役的信雖不及對珍珠港印度洋戰役那麼足，但是並沒有預感災難臨頭，是朦朦朧朧感太受束縛，缺乏靈活。「機動部隊的行動由在時間給限死了。」他解釋說，「由於對中途島發攻擊的日期已經確定，這就限定了機動部隊發攻擊的時間及其進攻位置的選擇。」【註：源田的陳述。】
戰前就感或至少承認己感憂慮不安的是極少數。三是其中一。他雖對取勝未表現懷疑，但確實感情況不妙，十分不安。五月十四日哀悼高橋死這，他在日記中寫，「據報海軍正在改變其建造戰艦的方針轉向建造航空母艦。說他們終於明白過來了，跟了形勢；但果他們現在就全面轉變，則他們比我們更先進。」這是麼敏銳、實在的法！
次日，日本偵察機報告，於南太平洋發現二艘航空母艦並正確判斷這是「企業號」
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