历史改朝换代，几乎前代的行政区划有所改动，但清应算是一特例。因清秉承明制，几乎有什变革。
清朝建立，在关内区设置行省，改承宣布政使司省，方最高一级的行政区划。除了明朝原设的十三省外，顺治元年（1644年），改明代北直隶直隶省。二年，又改南直隶江南省。了康熙年间，由觉十五省的区划，不便政令的颁布实施，清政府因此决定将一些省的范围再划一些，是分江南省江苏、安徽两省，分湖广省湖北、湖南两省，分陕西省陕西、甘肃两省，全国一共设有十八省，称“内十八省”（参见《清嘉庆二十五年〔1820年〕疆域政区示意图》）。
内十八省的格局，康熙朝历经雍正、乾隆、嘉庆、光、咸丰、同治六朝两百年有改变。十八省分别是：
（1）直隶省初治真定府，康熙八年（1669年）移治保定府（今河北保定），北境较明北直隶有所扩展。
（2）江苏省清初称江南省，治江宁府（今江苏南京）。康熙六年（1667年）分江南省东半江苏省，治苏州府（今江苏苏州）。
（3）安徽省康熙六年分江南省的西半置。初寄治江宁府，乾隆二十五年（1760年）治安庆府（今安徽安庆）。
（4）山西省治太原府（今山西太原），北境比明山西布政使司有所扩展。
（5）山东省治济南府（今山东济南），不再辖有明山东布政司所包括的辽东司区。
（6）河南省治封府（今河南封）。
（7）陕西省康熙二年（1663年），将陕西省一分二，东部仍称陕西省，治西安府（今陕西西安）。
（8）甘肃省康熙二年（1663年），分陕西省西部巩昌省，五年又改称甘肃省。初治临洮府，乾隆三年（1738年）移治兰州府（今甘肃兰州）。
（9）浙江省治杭州府（今浙江杭州）。
（10）福建省治福州府（今福建福州）。康熙二十三年（1684年），增领台湾澎湖诸岛。光绪十一年（1885年），又分福建台湾府设立台湾省。
（11）江西省治南昌府（今江西南昌）。
（12）湖北省康熙三年（1664年），分湖广省北部置湖北省，治武昌府（今湖北武汉）。
（13）湖南省康熙三年（1664年），分湖广省南部设立湖南省，治长沙府（今湖南长沙）。
（14）广东省治广州府（今广东广州）。
（15）广西省治桂林府（今广西桂林）。
（16）四川省治府（今四川）。与明四川布政使司相比较，西境扩展，南境缩减。
（17）云南省治云南府（今云南昆明）。与明云南布政司相比，东北境有所扩展。光绪年间，云南西部的茶山、麻栗坝等，铁壁、虎踞、马、汉龙等关划归英属缅甸，云南南部的乌、孟乌二土司划给法属趾支那（今越南）。
（18）贵州省治在贵阳府（今贵州贵阳）。与明贵州布政使司相比，西北境有所扩展。
清朝内十八省的各辖区范围，与现在我名称相应的各省的幅员相比，差别不是很，除了分置台湾、宁夏与海南三省及京、津、沪、渝四直辖市外，有什根本的变化。
清朝不仅在省的划分体承袭明朝的旧区划，且在官员的设置方面，继承了明朝的制度。清朝采明代的总督巡抚制度，总督、巡抚方的最高一级行政长官，且总督、巡抚的辖区调整与明朝的省界相一致。但是，由按照明制，省的长官应称布政使，不是总督、巡抚，因此清朝的省实际并不是正式的方最高一级行政区划的称呼，说是一俗称。
一般说，清朝的每总督统辖两三省，主管军，兼管民政监察方官员。了乾隆年间，将总督设置的数目确定，一共设立了八总督，分别是直隶、两江、闽浙、陕甘、湖广、两广、四川、云贵总督。不八总督的辖区并有完全覆盖清朝的内十八省，山东、山西、河南三省就不设总督，设巡抚。巡抚通常管辖一省，负责一省的民政务。不，有例外，直隶、四川及甘肃三省就有巡抚。因此，清朝的巡抚一共有十五：山东、山西、河南、陕西、江苏、安徽、浙江、福建、江西、湖北、湖南、广东、广西、云南及贵州巡抚。
由总督、巡抚统管一方，权力很，因此，清朝前期中期，让满人与汉军旗人担任总督、巡抚的职务。康熙期，汉人担任总督、巡抚的“十无二三”；乾隆期，巡抚一职，虽满人与汉人各占了一半，但总督仍是由满人任；了咸丰年间，由镇压太平国义军的需，情况有所改变，汉人充任总督、巡抚的逐渐增。
总督、巡抚在各省的辅助官员是布政使（又称藩司）按察使（又称臬司），原明朝在方所设的指挥使一职，由卫所制度的废除被裁掉了。布政使分管一省的民政财政，按察使则掌管一省的司法刑狱。清朝中期，布政使按察使实际已沦总督与巡抚的属吏。另外需说明的是，照理由布政使司是省级政府，一省应该有一，但是江苏省却现了设有两布政使司的现象。江苏省本已有江苏布政使司，驻在苏州府。但在乾隆二十五年（1760年），又增设了江宁布政使司，驻在江宁府，与江苏布政使司划区分治。，就使苏州府与江宁府并江苏省的省。
布政使司与按察使司的辅佐官员称员，其中由布政使司的参政、参议派的员，驻守在一定的方，有固定的辖区，称分守，主管钱谷政务；由按察司的副使、佥派员，分巡某一区域，称分巡，主管刑狱案件。乾隆年间，虽员由原的临派遣变了方实官，但是实际并有一级行政区划，称一级准政区。在分守与分巡外，清朝在各省设置有不少有区划的专职员，督粮、盐法、河、驿传、海关等。
清朝省的方行政区划分府（直隶州、直隶厅）、县（散州、散厅）三级，又恢复了单式的三级制。
府是省的一级行政区划，其辖县（州、厅）。府的行政长官称知府，首所在的顺府与陪所在的奉府，由位重，其长官叫做府尹，与一般的知府相区别。知府总领一府的务，凡是一府的政务，必须经由知府达给一级的长官总督或者巡抚，获准许，才执行。知府的佐贰有同知、通判、推官等。雍正中期，全国共设有一百六十七府，了乾隆年间，增加一百八十四府。光绪二十五年（1899年），又增一百八十七府。清朝末年，全国共有府两百。
清朝初年，知府佐贰官员中的推官被裁撤掉，另外的两佐贰同知、通判便被派府内各分防，间一长，其驻各的办机构便演变一新的行政单位——厅。在边境少数民族聚居区中不适宜设置州县的方，设厅，同知或者是通判便了厅的行政长官，负责管理厅内的务。清朝的厅分直隶厅散厅，直隶厅隶属布政使司，位与府或直隶州相，但是很少辖县；散厅一般隶属府，与县同级。光绪末年，全国有直隶厅、散厅一百。
州有直隶州与散州分。直隶州直属布政使司，与府相，其辖县，是规模略已；散州隶属府，与县相，其不再领县。直隶州与散州的行政长官称知州，掌管一州的务，佐贰有州同、州判等官，分别负责粮务、水利、防海、管河等方面的情。了光绪末年，全国共设有两百直隶州与散州。
县是方最低的一级行政机构。县的行政长官称知县，是亲民官，直接统治本县的人民。有关赋役、诉讼、文教等方面的情，由知县管理。佐贰有县丞、典史各一人，设有主簿一职。清朝末年，全国一共设有一千三百五十八县。