治平二年（1065）正月，苏轼返京，与父亲弟弟一团聚。旋奉诏命，差判登闻鼓院。
登闻鼓院是谏官组织中的一单位，隶属司谏正言，掌管收受官民投递的章奏表疏，不论是说朝政失、公利害，是理雪冤滥等，皆许鼓院击鼓进状，告密或检举官吏，并许密封呈进。吏民有冤屈，借此申告，是北宋政制中一很的制度。
英宗皇帝在藩邸，久已习闻苏轼的文名，是，便循唐朝的先例，特命召入翰林，知制诰。
宰相韩琦不，曰：“轼才，远器，他日。在朝廷培养，使士，莫不畏慕降伏，皆朝廷进，取，则人人无复异辞矣。今骤，则士，未必，适足累。”
英宗说：“且与修注，何？”
琦曰：“记注与制诰邻，未遽授。不若馆阁中近贴职与，且请召试。”
英宗说：“未知其否，则试。轼，有不耶？”
韩琦仍坚持苏轼年少资浅，未经试，不骤与侍从职，最决定依照一般通例，召试士院，且与馆职。
殿陛间番讨论的言语，不免外传，欧阳修怕执政官中有与韩琦不睦者（暗指曾公亮），借此挑拨是非，所特向苏轼解说，苏轼：“韩公所某意，乃古所谓君子爱人德者。” 韩琦此举，倒是的史论有很批评，韩琦号名相，但面杰异的人才，仍计寻常尺寸，不破格擢，认他太官僚化了。
二月，召试士院。试两篇论文，题一《孔子从先进论》，一《春秋定邪正论》，轼复最高分的“三等”入选，治平三年（1066）二月乙酉，殿中丞直史馆。
宋设三馆——集贤院、史馆与昭文馆，掌管校雠典籍，管理图书等。馆职首重文才，故试论文，一经入选，便名流，其职位高者修撰，次直馆，再次校理，卑者曰校勘、检讨等。苏轼《夜值秘阁呈王敏甫》诗，一颇有些许富贵气象：
蓬瀛宫阙隔埃氛，帝乐香似许闻。
瓦弄寒晖鸳卧月，楼生晴霭凤盘云。
共谁臂论今古，有闲此君（藏书）。
隐本无境界，北山猿鹤谩移文。
苏轼既已回京供职，老父人随侍，闲居南园已历三年的苏辙便始活动，三月名府推官。
但至五月二十八日，苏轼忽又逢丧妻痛。夫人王弗仅二十七岁，有一儿子，不满七岁。他俩的婚姻生活有十年，十年面，正是丈夫外求取功名，庭残破，离合无常的艰难期。在侍奉翁姑，勤俭谨肃，声闻戚党；随夫游宦凤翔，深知的丈夫缺乏社经验，生又化，就专注意他在外面的每日行，细观察与丈夫往的朋友，精明的头脑，帮他辨析人情理，及谏诤，避免。
王弗夫人的谨言慎行，正是苏轼所最缺乏的修养。的精明干练，使苏轼产生很依赖，隐做了丈夫的护身神，今一旦丧逝，怎不令他痛恸。
父亲嘱咐儿子：媳妇从你艰难，将，你必须将葬在其姑侧。在的族观念，是一崇尚与敬爱的表征。所苏轼《亡妻王氏墓志铭》说：“君从先夫人九泉，余不。呜呼哀哉！余永无所依怙。君虽，其有与妇，何伤乎？呜呼哀哉！”
苏轼夫人王弗的敬爱，永远不衰。十年，熙宁八年（1075）的正月二十日，他在密州梦见夫人，犹是凄切难遣，《江城子》词：
十年生死两茫茫。不思量，难忘。千孤坟，无处话凄凉。纵使相逢应不识，尘满面，鬓霜。
夜幽梦忽乡。轩窗，正梳妆。相顾无言，惟有泪千行。料年年肠断处，明月夜，短松冈。
六月初六，殡王夫人京城西，运柩回籍，葬翁姑茔墓西北八步。
些年，苏氏的运实在不，死亡相继，骨凋零，苏洵《极乐院造六菩萨记》说：“长女夭，不四五年丁母夫人忧。……其五年，丧兄希白（苏澹），又一年长子（景先）死，又四年幼姊亡，又五年次女卒。至丁亥岁，先君（父苏序）世，又六年失其幼女（嫁程才八娘），服未既，有长姊丧。悲忧惨怆气，郁积未散。”越四年，轼、辙兄弟又丁程太夫人忧，所谓“三十年间，骨亲零落无几”，是促使老苏誓远游四方的一重原因。
，曾不几年，丧母，苏轼又悼妻亡。距妻亡十一月，治平三年（1066）四月，老父忽又疾革，二十五日逝世，享年五十八岁。苏洵所编礼书，甫经稿，由欧阳修领衔，与礼官李柬、宋敏求、陈绎、李育、姚辟、苏洵等联名奏，尚未报；撰《易传》，亦未完稿。临终前，苏洵遗嘱两件：“未完的《易传》，希望他两兄弟续写书；兄澹（希白）世早，子孙未立，他照顾；妹嫁杜氏，死未葬，轼负责葬。”苏轼涕泣受命。熙宁元年遵遗命杜氏姑母茔葬眉山，又他官荫补亲族，奏请荫补伯父（苏澹）的曾孙苏彭，决定候。
苏洵逝世，奏闻朝，英宗诏赐银一百两，绢一百匹。苏轼辞赐银绢，父求赐官爵。六月九日诰赠光禄寺丞，同特饬有司备具船，载送灵柩归蜀。
韩琦、欧阳修各致厚赙，均辞不受。
据欧阳修所撰墓志，苏洵的著述有《文集》二十卷、《谥法》三卷、又《易传》未。另见其他著录者则有《洪范图论》《皇祐谥录》（《宋史·艺文志》）及《批点孟子》二卷。
六月，兄弟扶护父亲的灵榇王弗夫人柩，一舟两棺，汴入淮，溯江。
至江陵，初识他夙所敬佩、风骨嶙嶙的刘挚，其他江陵府的观察推官；在途中又与史馆的同李师中相遇，其师中方守凤翔，赴任中山。
兄弟护丧乡，遵礼在守制。治平四年八月，合葬父母武阳（彭山）县安镇（蟆颐）山老翁泉；同葬王弗夫人其侧。
居无，苏轼在整理旧书中，现父亲疏写数纸祖父（苏序）的迹，似乎是写篇行状并未完稿的残篇，是决定代他父亲了此愿，撰《苏廷评行状》。又将篇行状抄录副本，写了信托人携曾巩，求撰墓碣书。《曾南丰集》有《赠职方员外郎苏君墓志铭》，即是轼所求文。
居丧期间，听了许的神秘故，了不少名画，他的族兄僧惟简从他，苏辙所的河朔兰亭拓本他带回寺刻石，并跋。苏轼在凤翔所购的四扇吴子画四菩萨真迹的门板，次带回，就代他父亲施舍给惟简的庙中，惟简造一阁，专藏此画，且绘苏洵像其，永念。造阁预算需钱百万，苏轼认捐二十分一。
熙宁元年（1068）七月除丧。十月，苏轼续娶王弗夫人的堂妹王闰继室。闰夫人字季璋，青神县王介（君锡）的幼女，其弟王箴（元直）苏轼前次母丧归乡，两人尝同坐在庄门前吃瓜子炒豆者，现在则已长，从苏轼问。
十二月，轼、辙兄弟再度携同属京，将乡中祖坟的修护照，田宅的纳经纪，亲戚的酬酢等，委托了老邻居又总角的杨五哥（济甫），遇，则堂兄子安做主。
同乡的父执辈王淮奇（庆源）、蔡褒（子华）、杨宗文（君素）送行，蔡褒在他纱縠行的老宅中荔树一棵，说待荔树长，望见他回。
但是苏轼此，了二十二年，他在杭州任，不乡，《寄蔡子华》诗，无限惆怅：
故人送我东，手栽荔子待我归。
荔子已丹吾白，犹江南未归客。