由在行动前缺乏广泛的支持，明智光秀虽功杀死了信长信忠，并强迫朝廷册封己征夷将军，其又占领了山城国近江国的几乎全部土，但却难取更进一步的进展。与己有着姻亲关系的细川氏拒绝合，驻扎在近畿内的中川清秀、高山右近等原本隶属其指挥的部队有加入明智光秀，随着间的推进，其位愈危险。他本人已经认清果己不迅速获原织田众将的支持，柴田胜或羽柴秀吉等人讨伐叛徒的名义己动进攻，明智军现有兵力很难在战中获胜利。因此在受封征夷将军，光秀便向全檄文，求各名与其合，但一行动却根本有任何回应，最终他在留明智秀满驻守安土城抵御柴田胜行率军平定近畿。
与此同，远在备中高松城与毛利军垒的羽柴秀吉截获了明智光秀的使者。收信长遭刺杀的消息，秀吉立刻在毛利军尚不知此与其议，并立刻始准备返回近畿。在按照议条件求高松城主清水宗治切腹杀，秀吉6月6日率军回了姬路城，随即在将己的财产分给手军队始迅速返回近畿，并在途中取了附近区的织田众将支持，11日秀吉抵达尼崎城，其军队人数已经达了4万人。
6月13日，明智光秀在山崎被羽柴秀吉击惨败。明智光秀在试图逃回坂本城途中被猎杀落难武士向其手邀功请赏的百姓杀死。从6月2日凌晨的本寺变6月14日被百姓杀死，光秀征夷将军职称人的间仅延续了12便宣告结束了。
在山崎战中击败明智光秀，羽柴秀吉在短间内便扫清了明智光秀的全部残余力量，功将近畿区握在了己手中，接其将面的则是一系列政治问题。由信长嫡子信忠均已丧命，织田的命运便被握在了羽柴秀吉、柴田胜等几位方面军司令手中。在些重臣中，刚刚击败明智光秀的羽柴秀吉无疑是声望最显赫的一位。柴田胜、羽柴秀吉、丹羽长秀、池田恒兴在清州面讨论织田应由何人继承，柴田胜在议拥戴信长的三子织田信孝，秀吉则信长早已决定将督传给织田信忠由决定拥立信忠子，此年仅三岁的织田秀信。丹羽长秀池田恒兴二人早在山崎战便已接受羽柴秀吉指挥，此站在了秀吉一边，使秀吉最终功压倒了胜，织田秀信监护人的名义了织田氏的实际控制者。
不在此，柴田胜又与织田信孝及东海区的军团司令泷川一益结同盟抗秀吉，信长的妹妹阿市甚至在信孝的主持嫁给了柴田胜。一，织田内部间的冲突已经无法避免了。1582年12月至1953年7月间，羽柴秀吉进行了两次卓越的战役，分别击败了织田信孝、柴田胜泷川一益。在些战役中，与织田信长一，羽柴秀吉是凭借着京的内线优势，才总数并不占优的兵力击败了东南的泷川一益、东北的柴田胜及东面的织田信孝三人。
柴田胜战败杀，秀吉又逼迫织田信孝切腹裁，泷川一益则在7月初选择向秀吉投降。至此，秀吉已经平定了织田氏原有的全部领土，其周围的杉氏、德川氏、长宗我部氏及毛利氏在此期间却并有其进行任何干扰。回京，秀吉令在石山本愿寺的原址建筑一座比安土城更加宏伟壮丽的坂城。
不秀吉却并有享受太长的平，了1584年，原本支持秀吉的织田信雄又连结德川康向秀吉宣战。果康在一年前与泷川一益同从东海兵，很便迫使秀吉无法在东海仅留一支监视部队将主力全部投入与柴田胜的决战中。了1584年，德川康织田信雄便单独面占有绝优势的羽柴军了。
与人数众的秀吉相比，德川康手中此仅有35000人的动员兵力，即使加织田信孝，总兵力仅有60000人左右。秀吉的兵力在与所有臣合兵力达了125000人，是前者的两倍。但德川康却在牧山与秀吉垒达八月久，甚至在4月9日至10日的长久手战中取了一场并无决定意义的胜。直11月，秀吉才终设法与织田信雄单独媾，使德川康陷入了孤立。一月，德川康将三子德川秀康送给秀吉其养子，与羽柴军媾，历超八月的1584年战役画了句号。
在整场战役中，虽秀吉最终是达了平定东疆的目的，但却使德川康在国内赢了极的声望，一跃了除秀吉外最具影响力的名。使康臣服己，秀吉在两年主动提让己的妹妹与康联姻，其促康京觐见宣告臣服，秀吉甚至暂将己的母亲给康人质，保证己在康京不暗害者，才终使康坂宣告臣服。
在利两年间彻底解决了东疆危机，秀吉终将目光转向西方，并在1585年1587年分别击败了四国的长宗我部元亲九州的岛津义久。
早在1582年击败明智光秀，秀吉便不断向朝廷示，取了者的支持。与德川康讲，秀吉曾一度希望皇加封己征夷将军，便己设幕府。虽皇室曾在平安代末期源氏从未获封此职借口拒绝木曾义仲，但现在一职务却又因必须与镰仓幕府具有继承关系变非源氏不了。由身低贱，秀吉甚至无法像德川康等人一伪造谱声称己是源氏身，最拜公卿近卫前久养父，了藤原氏的一员，并终在击败长宗我部被朝廷任命代替皇治理的关白，年底又了公卿的最高官位太政臣，并受皇赐姓丰臣，了除源氏、平氏、藤原氏、橘氏外的五皇族姓氏。在那，丰臣秀吉向全国所有名宣布《总无令》，求各名间未经关白许不武力解决争端。在经历了长达百年的战乱，武士的终由一位农民子统一了。
1590年，丰臣秀吉调动20万军，在一场巨的围攻战中消灭了试图割据关东的北条氏。田原战役结束，关东区的原北条氏领被封给了德川康，使者的领增加了250万石，了除丰臣外日本最有实力的名。德川原有的东海领则纳入了丰臣的直辖领。通一措施，秀吉终使己一直忌惮的康远离了近畿区，在军无法再丰臣政权的核带构直接威胁。伊达政宗则因在田原战役中迟被迫将津给了蒲生氏乡，者在次年彻底压平了日本东北区的一揆势力。
1591年，日本已经完全处丰臣秀吉一人的统治，西九州、北至虾夷的全国土已经恢复平。但他很快就现己有很问题必须解决。早在约五十年前，西班牙葡萄牙的传教士便从九州进入了日本。1587年秀吉远征九州，虽基督教势力在秀吉的战略核近畿并有展，但在九州却已经形了一股巨的力量，信徒已经达了20万人巨，且手中掌握着一座放港长崎。九州征伐结束不久，秀吉便将长崎划入了己的控制范围，并宣布驱逐伊比利亚半岛的传教士。不与此同，了赚取量税收，他允许欧洲商人继续与日本进行贸易，并鼓励日本商人前往菲律宾等经商。
将全国的税收及兵役制度精确化，秀吉从1582年便始在己的领内进行检，即丈量农田面积，估算粮食产量。在征服整日本，又将一政策推广了其余名的领。在稳定了农业经济基础的同，秀吉京、堺町及九州博等区的商业采取了刺激支持手段，将些区紧紧握在了己手中，使其他的另一经济源。此外，全日本的主金矿被秀吉掌握了。
在些巨资源的支持，秀吉重新修缮了皇的宫殿及公卿的宅邸、寺院及神社，并经常向皇进献金银珠宝，使朝廷己的支持与日俱增，稳定了己权力的基础。确立己在皇室中影响力位的同，丰臣政权在致力控制社底层的农民力量。1588年，秀吉颁布了刀狩令，宣布严格禁止农民保有刀剑、长弓、长矛或者铁炮等任何类型的武器。通收缴农民武器的行动，秀吉实强化了信长所推行的兵农分离制度，并借此彻底毁灭了一向宗义的军基础。
1592年，丰臣秀吉已经建立了一平秩序井的日本，但国内名却并有安定。在丰臣秀吉前，织田信长了避免名依占有己的领土，不惜花费量间鲜血执行消灭政策，试图将日本所有土全部划入织田氏名，避免日本统一再生战乱。秀吉却与完全相反，位关白愿意臣服他的名，一律加宽赦，使他保留至少一部分的原有领
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