在征服琉球，幕府突令诸名不再建造或保有载重量超500石的船，始实行海禁。不由幕府与荷兰正式建，并允许者在九州的平户设商馆，因此日本在与中国恢复贸易的涉失败并有完全锁国，康本人甚至鼓励各名与荷兰、英国进行贸易。由丰臣秀吉的禁教令因无法将外贸易与宗教剥离遭失败，使康在接管日本政权便一直在寻求贸易宗教进行切割分离的手段，与荷兰的正式建终使康找了办法。
在信长秀吉政权期，日本与西班牙葡萄牙进行的贸易中掺杂着量欧洲传教士。在与荷兰进行贸易，者却并有将宗教融入贸易中，就使康决在1612年1613年连续两次布禁教令，始基督徒进行规模镇压甚至屠杀。实行铁腕统治闻名的德川光期，幕府垄断了全部的日荷贸易利润，并在因高税收屠杀教徒双重原因导致的岛原乱始实行彻底的锁国政策，禁止日本人走西至马、南至琉球、北至虾夷的区，除荷兰外禁止欧洲一切国与日本进行贸易，居住在日本的荷兰人被全部迁居了长崎，其余国籍的欧洲人则更是被统一驱逐境。除此外，仅有朝鲜中国商人仍在与日本进行着非正式的贸易。
江户幕府初期最规模的暴乱，岛原乱原本并非因宗教原因，是因幕府强加给岛原藩的重税。1634年至1637年间，由九州的岛原区连续年生灾，幕府却并有减少岛原藩所求的税收，岛原藩主松仓重政采取严刑峻法，逼迫农民缴纳他无法负担的赋税，再加此前松仓因禁教令基督教徒进行了残忍屠杀，最终导致岛原区的农民生义暴动。义的领导人则是原先西行长的臣益田次子益田贞，改名草四郎。
在笃信基督教的西行长影响，草四郎同信奉基督，并在义军中宣扬基督教中人人平等的思。1637年10月20日，义军已经包围了岛原城。7，草群岛爆了义，甚至在11月14日击败了唐津藩的镇压军队。德川光震怒命令己的部板仓重昌前往九州，将附近各藩军队集结镇压义军。1637年12月，幕府已在岛原附近集中了将近12万人的部队，岛原草两义军虽已经合了一，但人数仅有3万人左右，且其中很一部分人根本有战斗力。草四郎率领义军退守岛原藩南部的废弃城堡原城，并在原城竖了十字架振奋士气。次年新年，幕府军原城动攻击，但却并有在战斗中取优势，死伤人数达3900人，甚至连板仓重昌本人在攻城战死了。接替其任指挥官的松平信纲一直将围城态势维持了2月旬，才终在义军耗尽补给28日攻陷城池，并在城内进行了规模屠杀。
日本的锁国态势此平稳持续了200余年间。在1850年前，西方列强在欧陆洲的争夺使他无暇顾及亚洲方向。荷兰人保证己独占日本的利益，一直在其余国进入日本加阻挠。直19世纪初的拿破仑战争期，荷兰了拿破仑实的属国，才给了英国攻击荷兰船并切断其欧亚贸易航线的理由。1814年拿破仑一次退位，英国船在17世纪的初步探索重新回了太平洋海面。不在那前，俄国人便已经从北方将己的触角伸向了东亚。从18世纪30年代，俄国探险商船便始在日本海域现，有甚至在幕府管辖较松懈的区靠岸进行补给或从贸易。
日本方面此不完全有警觉。18世纪80年代，幕府便曾专门商讨外国船在日本现己该采取何策，但并有具体结论。1808年，几艘俄国船摇摆公进入江户湾，求日本放同俄国的贸易往，并此袭击了江户附近的一些村落，试图逼迫幕府满足己的求。几乎与此同，一艘在太平洋区寻找法国船的英国战舰进入了长崎港，求日本人其提供补给。虽幕府一度两同生的件焦头烂额，但不久俄国人英国人便离了日本。拿破仑战争结束，荷兰重新独立国，恢复了己在日本的独占位，英国船在日本现的次数并不。
一情况并有持续太长间。19世纪20年代，随着西方捕鲸业的迅速展，越越的捕鲸船始现在西太平洋方向，日本东北方的海域他言是一块利润非常丰厚的捕猎场。些捕鲸船一旦失或需补给便前往日本，求幕府其提供帮助。1824年，水户藩萨摩藩便与西方船员生了两次冲突，一位萨摩武士甚至拔刀砍伤了方。由担西方势力越越进入日本，幕府从18世纪末始逐渐形了一抵制思，并在1800年正式向各藩令应击退或扣押一切试图在长崎外区靠岸的外船。不避免与西方船生武装冲突，法令又被改向些船提供给养，但不允许其进行贸易，并应在最短间内将其送国境。在1824年的两次冲突生，幕府重新转强硬，并在次年专门颁布法令求名在外国船必须立刻赶走方。
1842年，幕府方面知清帝国在鸦片战争中遭失败，荷兰方面向幕府了警报，声称一支英国舰队正在驶向日本，很向幕府提进行由贸易的求。虽最终并有英国舰队抵达日本，但幕府方面却是些情况感胆战惊。此的日本言，亚洲陆的中国拥有着高不攀的实力，果欧洲人够轻易击败中国，日本便无法在战争中幸免。水户藩主德川齐昭在1839年曾表法：
“由清国拥有十分强的力量，因此夷人不其轻举妄动……俄国很首先征服日本，再征服清国……”
虽德川齐昭的判断并不正确，但却明白表达了欧洲列强征服日本的担。在中国失败，日本更是岌岌危。巨压力，幕府被迫再次改变政策，同意向外国船提供补给。此十年间，虽一些欧船陆续日本，并提了通商求，但在幕府新政策的缓冲并有造冲突。
1846年，幕府又一次面临危机，法国舰队突现在了琉球，求与日本进行贸易。在此前三年，国军舰“哥伦布”号便曾江户，提通商求。幕府言，琉球江户是完全不相提并论的两问题，前者本身是萨摩藩的属国，处偏远，即使允许法国通商不日本本土造太影响，但江户却是幕府的核，一旦答应了国人的求，其果便很无法收拾。因此幕府虽拒绝了国人，但却将琉球问题给了萨摩藩主岛津齐兴协调解决，力求在不改变锁国政策的基础与法国达协议。果无法达一点，那便同意放琉球。幸运的是，法国人并有坚持己的求，很快便锚，此七年间西方列强有再日本。
实，英国法国等欧洲国言，虽武力强迫日本国并非难，但由日本与欧洲遥远，其产的物资、商品又够在中国等取，并不值劳师动众兵压迫幕府，有必花费资金在日本维持另一支舰队保卫己的利益。因此有距离更近的国俄国才真正希望打日本市场。国言，日本是其跨越太平洋进入亚洲陆的理跳板，俄国言日本则是挡在其通往太平洋路的绊脚石。
此幕府虽本仍希望恢复原先的完全锁国政策，但却已经有无力。“哥伦布”号江户，其搭载的火炮超了江户沿海炮台所有火炮数量的总，威力更是占据着压倒优势，幕府生招待国船员，直将其送日本前在避免惹端。在此，幕府虽已经认清凭现有军力量根本无法恢复击退政策，并始着手加强各海防，但由其军科技、战术及战略观念早已落西方，因此其战备工是白白耗费国力间。
在17世纪至19世纪的欧洲战场，火绳枪逐渐演化了燧枪，又诞生了线膛枪装步枪，随着火器威力的逐渐增，贵族身穿着的甲胄已经无法再己提供保护，反了束缚手脚的负担。因此除少量甲骑兵外，装甲已经被完全从军队中淘汰了。依靠方阵的冲击战术在愈减，各国军队在战场的队形变越越薄，使其更易扬火力。刺刀则取代了长矛步兵最主的白刃战武器。19世纪初的拿破仑战争中，法国军队又够将灵活机动的纵队散兵战术与横队配合在一，同炮兵无论在野战是围攻战中早已了决定力量。19世纪中叶，随着线膛枪膛枪的普遍采，步兵甚至已经有必再采取齐战术
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