1928年，清华由罗伦就校长职，高谈“纪律化”，象征着一“新代”的始。新代有新气象，但仍不免“旧代”的争权夺利。清华校长一职，就有三十人争夺。甚至有比“旧代”更“青蓝”的表演。陈寅恪庚午年（1930年）所《阅报戏二绝》，表达此“新形象”的观感：弦箭文章苦未休，权门奔走喘吴牛；由共文人笔，最是文人不由。
石头记中刘姥姥，水浒传王婆婆；他日君佳传，未知真与谁同科？陈寅恪很有幽默感。在陈哲三的《陈寅恪先生轶及其著》有的回忆:有我在座，先生说：“我有联送给你：南海圣人再传弟子，清皇帝同少年。”是说我是梁启超、王国维的生，是康有的再传弟子，是溥仪的少年同。哄堂笑。更妙的是北伐功。全国统一，罗伦接任清华，特意望陈寅恪，陈哲三等同在场。罗伦送给陈寅恪一本书，是他编的《科与玄》，记述张君劢、丁文江辩论的一段文坛旧。陈寅恪翻了翻便说：“志希，我送你一联何？”罗伦说：“甚，我即刻买的宣纸。”陈寅恪说：“不了，你听着：不通法科玄，语无伦次中文西文。”罗伦一摆手，笑不止。陈寅恪又说：“我再送你一匾额：儒将风流。你在北伐军中官拜少将，不是儒将吗？你讨了漂亮的太太，正是风流。”联中将“”、“伦”二字嵌入，精妙极。陈寅恪才思敏捷，诙谐风趣，率此。其实他的一戏是有深意的。陈寅恪科与玄争，中西文化论战，皆不。他一生秉承的思，是调中西，中体西。吴宓曾此是的评语，陈寅恪己此承认。幅即兴所的联，就是思的表露。
国研究院结束，陈寅恪转任清华中文、历史两系的合聘教授，并两系的研究所专题课。在中文系授“佛经文”、“世说新语”、“唐诗校释”等课程；在历史系授“魏晋南北朝专题研究”、“隋唐五代史专题研究”等课程。他的教研究经常是相互配合的。从他的课，知他的研究方向已经从佛教史研究，扩整中国中古的文史研究。同，陈寅恪在课余，博览群籍，研究内容主集中在唐代文史与佛经领域，讲授的内容主是与此有关的专题。就讲授的课程论，陈寅恪革新了及高级研究院校的研究领域设课程。他比汉、唐、宋及明清有就的著名者，向前进了一步，中国的术文化研究辟了新纪元。在一期间，陈寅恪使敦煌所的文书，著文篇。在《陈垣敦煌劫余录序》中，陈寅恪说：“一代术，必有其新材料与新问题。取此材料，研求问题，则此代术新潮流。治士，预此潮流者，谓预流（借佛教初果名）。其未预者，谓未入流。此古今术史通义，非彼闭门造车徒，所同喻者。敦煌者，今日世界术新潮流。”陈寅恪通解中外古今的术文化，因有立喜马拉雅高峰俯瞰人类文化进展的长河的精深宏议论。敦煌已是今日世界的显，陈寅恪是中国敦煌创者一，是提“敦煌”一名称的一人。一名称的提是有重意义的，他明确了敦煌资料的研究是我一代新的术潮流，不是整理考证一些资料已。近几十年，特别是从敦煌吐鲁番立，我国敦煌研究有了很进展，陈寅恪所期望我“勉敦煌预流”，已逐渐现实，是我告慰含恨逝的一代儒宗陈寅恪先生的。
民国二十一年（1932），清华中文系代理系主任刘文典请陈寅恪命招生试题：文题《梦游清华园记》，外加子：一年级“孙行者”、“少离老回”，二三年级的生有“莫等闲白了少年头”等，此招致纷纷非议。陈寅恪既在《清华暑假周刊》六期表答记者问，又撰写《与刘叔雅论国文试题书》，详释其义。同年，在历史系晋至唐文化史课，讲晋唐一历史期的精神生活物质环境的关系。讲精神生活包括思、哲、宗教、艺术、文等；物质环境包括政治、经济、社组织等。在讲论中，陈寅恪并不轻易讲“因果关系”，是着重条件。并且称往研究文化史有二失：旧派失滞。旧派所“中国文化史”，其材料采二十二史儒林文苑等传及诸志，及《文献通考》、《玉海》等类书。类书乃供科举策搜集材料，史有必全行采入。类文化史不抄抄已。其缺点是是死材料有解释。读不使人了解人民精神生活社制度的关系。新派失诬。新派是留生，所谓“科方法整理国故”者。新派书有解释，似乎很有条理，甚是危险。他外国的社科理论解释中国的材料。此理论，不是假设的理论。其所立的原因，是由研究西洋历史、政治、社的材料，归纳的结论。因人类活动本有其共同处。所“科方法整理国故”，是很有的。不有不适，因中国的材料有在其范围外。所讲“概似乎”，讲精细处则不够准确。讲历史重在准确，不嫌琐细。本课程的习方法，就是原书，从原书的具体史实，经认真细致，由思，批评态度。从些记录，见陈寅恪的治态度教方法。
陈寅恪从37岁（1926）初任教清华，48岁（1937年七七变），约十二年的间，住在清华园。一段间是他的一生中读书最勤、研究最力、收获最的日子。主是因生活较安定，图书资料较易获，研究条件较佳的原因。1930年，陈寅恪虽兼任“中央研究院”理、历史语言研究所研究员，并且兼一组主任、故宫博物院理、清代档案委员委员，但是不负实际务的责任，在他研究工中却了更的方便。陈寅恪此治勤，从他的长女流求的追忆中，略知一二：
从我记，我就住在清华园南院，移居新西院（按1935年），距西校门不远。中生活紧凑有规律。父亲每门总是夹着布包袱，包着书本。晚照例伏案工。父亲从不满足己掌握的治工具，每逢星期六午，不分寒暑进城东民巷找一位钢泰的外籍教师，习梵文。
此外，他又经常乘车从清华园高殿军机处档案。许机密文件满文书写，陈寅恪一边检阅，一边汉译，遇疑难的单字词句，就随手记录，便查字典或请人代解答。
在清华的十二年中，陈寅恪约表了五十余篇术论文序跋，在战表的书与文，其研究工实际是在此就已经完了的。随着研究果的滋长，他的术声名日隆。日本及欧洲的汉公认他博有见识的史。民国二十二年（1933），陈寅恪44岁。一年，有覆钱稻孙书，是答复日本者白鸟库吉询问有关中亚史的问题。陈哲三在《陈寅恪轶》文中叙述了蓝孟博的话：“民国二十二年，我在日本，有在东洋文库吃饭，饭闲谈，白鸟说：‘蓝君你认不认识陈教授？’我答：‘是不是援庵？’他说：‘不是，是陈寅恪先生。’我说；‘那是恩师。’白鸟一听，马隔桌趋前伸手。白鸟在日本史界，被捧太阳，何陈寅恪此尊敬呢？他说了，他研究中亚问题，遇困难，写信请教奥国者，覆信说向柏林某教授请教，柏林的覆信说应请教陈教授，钱稻孙度春假日本，正在隔房，他说代请教陈教授，钱的春假未完，陈教授的覆信已，问题解决了。他说无陈教授的帮助，至死不解。”惜不知日钱将此信原封给白鸟库吉，是使白鸟录副将原信留，此信已经不知流落何方。获原手迹，将陈寅恪的一段重文献。但从故，陈寅恪的国际声誉。
在清华，陈寅恪更是名教授。除了本校历史中文系的生听讲外，有校外旁听生，“慕名，满载归”。在燕京读书的周一良回忆：“我从燕京清华旁听（实际是偷听，因不需办任何手续）陈先生的课，感与往所听的中外历史课不相同，犹目前猛放异彩，佩服不已。那一听课的，有在的中央研究院历史研究所工的余逊、俞纲（已经逝世）。我几青年很喜欢京剧，课，常常讨论说：真瘾！像又听了一场杨楼的拿手戏！”罗香林回忆：“陈师生的爱护，真是无微不至，不但在术的别引导，使生走向专门研究，渐渐有新的现的境，就是生的日常生活，乃至毕业的就业情形，非常关。”
从生的回忆，知陈寅恪既是认真受欢迎的教师，是书斋中的者。他不喜欢管实际物，很少抛头露面谈政治。但并
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