蒙古族
元亡，蒙古贵族军士被迫回蒙古草原，经朱元璋次派人攻打，其内部生分裂。永乐初，蒙古分三部，即辽河、西辽河、老哈河流域的兀良哈，其西至杭爱山一带的鞑靼部科布河、额尔齐斯河及其南准噶尔盆的瓦剌部。由蒙古区与内农业区的长期隔绝，及草原封建主间经常生的相互掠夺的战争，使游牧经济凋敝，牧民的生活日益贫困。在明朝强盛，瓦剌鞑靼的统治者接受明朝的封号，在经济次与明朝进行互市。但每贡市的求不满足，便不断动战争明的挟。明朝政府了防止蒙古的侵扰，最初在北方设有辽东、宣府、同、延绥四镇，又增设宁夏、甘肃、蓟州三镇，加固原山西的偏关，称九边，皆布有重兵。明朝政府又积极在沿边修筑长城。据万历《明典》统计，九边所筑城堡、关隘、空台、墩台等共达一万八千余座。
频繁的战争并有阻碍蒙汉等各族人民间的往，长城有隔断彼此的经济文化的联系。许蒙古民众生活所迫不断向内迁徙，有的汉人因被蒙古统治者俘虏奴，或因逃避租役，或经营商业，量流入蒙古。隆庆，在蒙古古丰州（今内蒙古呼浩特东）一就居住有汉族人口五万余，居屋佃，名曰板升。俺答汗继位，特别是在他晚年三娘子 统治期，蒙汉间很少动战争。马市贸易极盛，除官市外，又与塞民互市。万历九年（1581）又修建了呼浩特城（蒙古语意青色的城）。此城很快展蒙古区与内贸易的商业市。长城附近延袤五千无烽火警，近疆水陆屯田悉垦治内。蒙古封建主的财富显著增加，其币帛牲畜，动万计，特别是鄂尔斯、土默特、察哈尔等部所在，随着内先进生产技术的传播，农业手工业（包括铁的炼冶业铸造业）的产量产品有显著增加。
藏族
明朝，藏民半农半牧生，农产品有麦、荞麦青稞，层僧侣各的部落首领构封建领主阶级，拥有量的田庄、财富奴婢，广藏族人民则是农奴。洪武，明政府在西藏等设立乌斯藏指挥使司及宣慰司、招讨府、元帅府、万户府、千户所等方行政机构，任命藏族的封建领主指挥使、宣慰使、招讨使、万户、千户等官职，赐给他诰命、印信，通他向所属藏民征收赋税。西藏喇嘛教的教派很，有噶派（红教）、噶举派（白教）、萨迦派（花教）本布派，每派又分若干派。噶举派帕木竹巴法王的权力最。明朝设帕木竹巴万户府，并封帕木竹巴法王“国师”，明朝在西藏封立三法王（宝法王、乘法王、慈法王）、五方王（阐化王、赞善王、护教王、阐教王、辅教王），此即西藏八王。八王各有封，分别统辖一定区，与明朝往十分频繁。
明初，宗喀巴在西藏创立格鲁派（黄教），他在西藏进行宗教改革，主张“敬重戒律”，提倡苦行。宗喀巴五弟子释迦失他的代表曾两次达北京，明祖封其“西佛子国师”，宣宗封其“慈法王”“国师”。此黄教在西藏的势力日，信仰者日。万历，三世达赖喇嘛索南坚错长期居留在西宁等，与蒙古俺答汗相友。与明朝首辅张居正有书信往，明朝封其“国师”。三世达赖喇嘛使黄教在蒙古广泛传播，在调明朝皇帝俺答汗的关系方面有较的贡献。四世达赖喇嘛云舟坚错曾万历四十四年（1616）神宗授予的“普持金刚佛”的封号，此，格鲁派的首领五世达赖喇嘛四世班禅借青海蒙古固始汗的兵力，推翻噶玛派在西藏的统治，黄教在西藏的政治位日益巩固，青海、蒙古及东北各喇嘛僧侣的支持。
明朝藏族人民与内各族人民间的往更加频繁。永乐五年（1407）至十二年，在藏汉各族人民的艰苦劳，修通了四川雅州（今雅安）乌斯藏的驿路。明朝在川、陇等设茶马互市与藏民贸易，准许西藏等的僧俗官员派使北京通贡，规定三年一贡，顺年间一次贡使至二三千人。人贸易被严格禁止，但汉藏两族人民间的贸易关系始终不断。藏民经常马匹、氆氇等物内换取盐、茶布匹，汉族商人从内携茶与易马，有人甚至越山涉水，深入藏族区从贸易活动。的河州、秦州（甘肃水）、洮州（甘肃临洮）、雅州打箭炉（四川康定）等，已经藏汉各族人民互市的场所，营贸易与官营贸易同繁盛。
格鲁派
中国藏传佛教影响最的宗派。格鲁，藏语意思是善律，该派强调严守戒律，称善律派。该派僧人戴黄色僧帽，故又称黄教。又因该派认其教理源噶派，故称新噶派。格鲁派强调修行次，显密并重，先显密；提倡苦行，僧人不结婚，戒杀生，禁饮酒，断绝世俗往等。该派在藏族、蒙古族居住区流传甚广。清代，格鲁派的达赖喇嘛与班禅两转世系统由清政府确认，格鲁派西藏方政权的执政教派，西藏政教合一的统治形式有了进一步的展。
维吾尔族
维吾尔族在明朝称畏吾尔，亦畏兀儿，是居住在新疆区的主民族。明代，除撒畏吾儿仍从游牧外，其他居住在阗（今新疆田）、喀什噶尔（今新疆喀什）、哈密、土鲁番（今新疆吐鲁番）等的畏吾儿人农业主，兼营商业，其手工业很达。其耕牧场部分掌握在封建主（蒙古族或畏吾儿族）的手中，一般农户则少或无，遭受封建主苛重的剥削。元末明初，畏吾儿族区者称国，者称面，形封建割据的形势。洪武、永乐、宣德间，与内恢复关系的国面，前共有七八十。明朝政府从太祖先在甘肃西部新疆东部区设立赤斤蒙古、哈密、沙州、安定、曲先、阿端、罕东、罕东左等八卫，卫设指挥，一度在柳城、火州（均在今新疆吐鲁番东南）等设指挥等官。明朝与哈密卫的关系最密切。永乐二年（1404），明政府曾封哈密王安克帖木儿忠顺王。景泰，土鲁番势力强，攻占哈密城，兵锋及嘉峪关内的甘州（今甘肃张掖）、肃州（今甘肃酒泉）等。从此明朝西域的控制日益松弛，不不在嘉靖八年（1529）放弃哈密。
苗、瑶、彝、壮各族
居住在云贵、四川、两广、湖广等的少数民族有苗、瑶、彝、僮（即壮）、黎、傣等族。各族间及同一民族不同区间的社经济展很不平衡。有的农业已有显著展，并普遍使犁耕。湖南一部分少数民族明中期已蓄食甚富；云南一些民族在平坝稻，一年两熟，产量在增加。但住在高寒山区的某些部落，生产力很低，有些仍处在刀耕火阶段。从社展的阶段，有些已由封建领主经济渡主经济，或是主经济已占统治位；有的阶级分化不明显，有的则已有阶级分化，始由原始公社制末期进入奴隶制，或已由奴隶制进入封建制。
明朝政府沿袭元朝的统治制度，在云贵、两广区设置土司，通各族的首领统治各族人民。但各的土司与明朝有矛盾，经常动叛乱。明朝政府在平定叛乱，往往些区的土司裁撤，改设流官，即改土归流。改土归流的目的是建立少数民族区的直接统治，但是在客观打破了农奴制度，促进了少数民族区主经济的展，同加强了中央与方的联系，维护国的统一有进步意义。
明朝统治期，云贵各经常爆各族人民的义。著名者有英宗正统十四年（1449）苗族农民的邛水十五洞司（今贵州三穗）义、英宗正统七年至世宗嘉靖十八年（1539）的广西桂平藤峡义。明朝有很汉族人民陆续迁至云贵、两广等，他不仅与少数民族人民一进行抗官斗争，先进的铁工具农业、手工业生产技术带了苗、瑶等族聚居的区，并从耕、矿、采茶、兴修水利，些区的了积极。
高山族
高山族是中国台湾的土著居民，长期就劳动、生息、繁衍在块土。16世纪，高山族已有达的农业，甘蔗棉花的植逐渐兴盛。在农业方面已铁锄耕，狩猎则已普遍使铁工具。狩猎剩余产品已换。高山族社的基层组织是部落，若干部落结合社。一社或千人，或五六百人，已有贫富差别阶级分化。随着东南区商品经济的迅速展，越越的汉族人民渡海台湾。濒海民每年有渔船在澎湖北港间打鱼，又有很人台湾与高山族进行贸易，或在山口设店，或径入山，玛瑙瓷器等换取鹿皮、鹿角，受高山族的热情接待。
万历、启间，颜思齐、郑芝龙等在台湾建立政权。他称君主，有官职，有武装，与高山族保持睦友关系。郑芝龙在台湾练兵积粮
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