准噶尔的叛乱刚刚平定，回部又生内乱。乾隆有的忙了。
回部是居住在新疆山南部信奉伊斯兰教的维吾尔族，在，伊斯兰教又被称回教，所清朝称人回部。回部与准噶尔邻近，长期受其奴役，准噶尔了控制回部，将回部首领弄伊犁人质。马罕木特是回部一深人的首领，噶尔丹策零了控制回部，将他软禁在伊犁。马罕木特死，他的两儿子卓兄弟被噶尔丹策零圈禁。
卓在伊斯兰语是“圣裔”的意思，就是穆罕默德的代，惜在强的武力面前，祖宗穆罕默德帮不了他。准噶尔回部的欺压是非常有人的，回部植的东西，不论是谷麦是蔬菜，了收割季节，先一分二，一半归准噶尔，一半归回部，再从回民的另一半征收十分一。准噶尔派回部的头目，所处，一定酒妇女款待。
清军将回部民众从准噶尔的奴役中解救，长期受囚禁的卓兄弟获了由。乾隆两兄弟深表同情，借助他的威望宗教影响力安定回部民众，命卓管理叶尔羌回部，卓管理伊犁回教。
惜，卓不但不知感恩图报，反寸进尺，摆清廷，立王。卓不仅己单干，怂恿卓跟己一摆清廷。乾隆二十二年，乾隆拿少有的脾气，派使者前招抚反骨兄弟，兄弟俩是铁了反，居乾隆的使者给干掉了。
乾隆气吹胡子瞪眼，怒：“决不任由使臣被杀，一定他报仇。”
乾隆任命雅尔哈善靖逆将军，征讨卓。说实话，乾隆实在低估了回部的力量，乾隆，不一世的准噶尔被我制服，昔日准噶尔的奴才居敢跟我叫板，不是找死是找抽。雅尔哈善原本是文官身，因屠杀沙克尔曼济受乾隆赏识，其实乾隆清楚，人并不擅长兵，但他武断认，付回部些乌合众，像雅尔哈善的人已经足够了，果像阿桂、兆惠的一流将军，反是杀鸡牛刀。
雅尔哈善率领一万八旗兵绿营兵，一路打回部北方重镇库车城，将城池包围。，雅尔哈善诸葛亮羽扇纶巾的子，整人棋，不击，坐等卓动投诚。部将阿奇木建议他应尽快击，因敌人有两条路逃遁，但雅尔哈善根本不理睬，信卓两兄弟一定送门。
终有一，雅尔哈善无法再淡定了，士兵听城中有驼铃声，告诉雅尔哈善，敌人正准备逃走。雅尔哈善仍不相信，但是已经在打鼓，法像前那羽扇纶巾悠闲棋了。
两卓在夜晚分，从西门潜走，沿着北山口逃夭夭。守西门的顺德纳听士兵报告认夜晚不适合兵，了二白才派兵追，刻舟求剑的故我知，果追敌人那就怪了。，雅尔哈善责任全推顺德纳身。乾隆将顺德纳革职，同责备雅尔哈善有责任，让他尽快攻库车城，并追击卓。
库车城依山建，城坚墙厚，易守难攻。提督马胜带着绿营兵挖，惜急躁，被敌人现，结果干柴堵住，将六百清军活活烧死。雅尔哈善再次责任全部推给属马胜，写，我雅尔哈善是一推卸责任的手，一有问题就让别人扛。乾隆让的人做主帅确属人失。
库车战从五月打八月，有半点效。雅尔哈善再次奏弹劾他人，战进展不顺的责任全往别人身推。收雅尔哈善的奏章，乾隆终，痛斥雅尔哈善主帅，不但有引咎责，反往别人身泼脏水，完全有主帅的子。随，乾隆让兆惠军中，将雅尔哈善押京城，最雅尔哈善在京城被正法，正应了初杀降不祥的预言。
兆惠再次担任了主帅，惜兆惠库车，回人已经放弃了库车城，退萨克苏，等待他的是一座空城。兆惠又挺军萨克苏，回部许头目纷纷请降。听回部许部落受抚的消息，乾隆征讨回部将马功，不需继续派遣援兵。兆惠带领四千兵士进攻萨克苏，面援兵中断，很快就陷入了困境。
兆惠在黑水营被数倍己方的回兵围困三月，与回军五次激战，双方伤亡惨重，兆惠几丧命。乾隆知前方战况，紧急调拨援兵，终，清军两路夹击，击败了卓。
乾隆二十四年六月，兆惠福德率领军卓的本营叶尔羌喀什噶尔进剿。黑水营败，卓已经失了战的信。此回部的人民早已他的统治不满，不跟着他一沉沦。卓是胁迫几千回人跟己一逃亡，在逃亡途中受清军无情的追击，卓在逃亡的途中被巴达克山汗素勒坦沙擒获。素勒坦沙割两人首级献给清廷，至此回部叛乱平定。
果给乾隆次武功评分的话，给五分。的回部居耗费两年才搞定，跟乾隆人失误有很关系。任命兆惠是的，但中途停止增援又犯了错，差点导致兆惠全军覆。所给五分，是因乾隆虽犯了一系列错误，但毕竟知错改。