高度集中的中主阶级基础的朱元璋封建统治政权，通庞的常备军严密的特务网，着镇压人民反抗保卫国防的。
在洪武一朝中，除掉秘密宗教徒少数民族的次义外，不带宗教色彩的农民义比任何一历史期。
据史料记载，在朱元璋称帝前，农民已经反抗了。龙凤十一年（公元1365）七月湖广辰州沅陵，十一月江西信州，十二年二月浙江处州青田，十二月永宁酃县，曾生农民义。称帝，洪武元年浙江昌国州，温州南溪，三年山东沂、邳山民，浙江龙泉，福建泉州惠安，湖广绥宁，六年福州府山民，温州府，福建罗源、古田，广东廉州，湖广房州，儋州宜伦，广西永福，十年宿州灵壁，福建泉州，十二年广东潮州海阳，福建漳州龙岩，广东清远，十四年漳州南靖、古田，浙江衢、处、温三府山民，潮州海阳、程乡，福建福安，广州海“寇”，漳州龙岩，十五年惠州龙川河源，潮州海阳，海南同文昌，万、崖二州，十九年潮州程乡，二十年惠州博罗，二十一年韶州英德，潮州海阳，惠州龙川，二十二年广东韶州，二十六年广东东莞，二十八年广东崖州，二十九年广东连山，生了农民暴动。值注意的是一系列农民反抗的武装斗争，除洪武三年山东沂、邳山民暴动外，其余的全部生在经济比较达的长江南区，其中，浙江温、处州各三次，广东海阳三次，程乡两次，龙川两次，福建龙岩、古田各两次。省区计，则广东一省就生了二十次。规模较的洪武十四年的广州海“寇”，曹真称万户，苏文卿称元帅，合山“寇”单志、李子文、李平尺据险立寨，攻掠东莞、南海及肇庆、翁源诸县，被官军镇压，斩杀五千余人，俘掳二万余人，属八千余人。十五年十月南雄侯赵庸镇压广东铲平王的义，斩杀八千八百人，俘虏一万七千八百五十人，属一万六千余人，降民一万三千二百六十七户。义的原因，主有两条，一是官吏贪污，一是守御官军扰害，就是官逼民反。 义的结局，被封建皇朝庞的常备军所血腥镇压失败。
常备军在国内的任务是镇压人民义。
朱元璋所建立的常备军是农业生产密切结合，逐步建的。在攻克集庆，厉行屯田政策，广积粮食，供给军需。他刘基研究古代的兵制，总结历史经验：征兵制的处是全国皆兵，有召集，定归农，兵员素质，路清楚，平军费支少；缺点是兵员农村，有长期战争，便影响农村的生产。募兵制的处是应募的无业游民，兵是职业，训练的期较长，战力较高，兵员数量服役间，不受农业生产的限制；缺点是平维持量的军队，军费负担很重，且募的兵部分路不明，有宗族庭的牵挂，容易逃亡，容易叛变。较的办法是折中两者间，吸收其处，避免其缺点。主的原则做武装力量生产力量结合。既灵活指挥，又避免财政重的负担。
刘基根据实际情况，经讨论研究，创立的办法是卫所制度。
卫所的兵源有四：一是从征，即所指挥的部队，就是郭子兴的基本队伍他己所招收的各主武装；一是归附，包括削平群雄所的部队元朝投降军队；一是谪，指因犯罪被罚军的，叫恩军；一叫垛集，即征兵，按人口比例，一有五丁或三丁一丁军。前两是建立制度原有的武装力量，两者则是补充的武力，特别是垛集军在数量占了很的比例。四源的军人是世袭的，了保障固定员额的满员，法律规定军人必须娶妻，世代继承，无子孙继承，则由其原籍属壮丁顶补。族绵延的原则被应武装部队，兵营武装的集体庭了。
军有特殊的社身份。在明代户籍中，军籍民籍、匠籍是主的户口。军籍属督府，民籍属户部，匠籍属工部。军人不受普通方行政官吏的管辖，在身份、法律、经济的位，民户不同，军民是截分的。民户有一丁被垛军，优免一丁差役，补偿。军士戍，由宗族替他治装。在卫所的军士除本身正军外，其子弟称余丁或军余，将校的子弟则称舍人。军士的生活费概由皇朝就屯田所粮食支给，按月米，称月粮。规定马军月支米二石，步军总旗一石五斗，旗一石二斗，步军一石。守城的照数支给，屯田的支一半。恩军四口一石，三口六斗，无口的四斗。衣服岁给冬衣棉布棉花，夏衣夏布，征依例给胖袄鞋裤。
元璋渡江，降附的将领原的称号，有叫枢密、平章的，有叫元帅的，有叫总管、万户的，形形色色，名不称实，高不一。龙凤十年四月，立部伍法，根据所带的队伍人数定将领称号。经点编，有兵五千的做指挥，满千人的做千户，百人的做百户，五十人总旗，十人旗。 在基础，常备军的组织分卫、所两级：体五千六百人一卫，卫的长官是指挥使。卫又分五千户所，每千户所一千一百二十人，长官是千户。千户所分十百户所，每百户所一百十二人，长官是百户。百户有总旗二，旗十。一总旗领五旗，旗领军士十人。联比军。卫所的分布，根据理险，据点设所，关联若干据点的设卫，集合一军区的若干卫、所，设置指挥使司，军区的最高军统率机构，长官是指挥使。卫所陆续建置，洪武二十五年，全国共有十七指挥使司，京师外共有三百二十九卫，六十五守御千户所。京师方的军力分配：
全国卫所军总数一百二十万人。十七指挥使司分别隶属皇朝的五军督府。
军食屯田，略汉朝赵充国的办法，在边境屯，一部分军士担任守御，一部分军士受田耕。目的在垦荒，增加生产，充裕军食，省运输费，减轻财政负担。边屯有了绩，内卫所先屯耕，每军受田五十亩一分，官给耕牛农具，头几年免纳租税，熟，每亩收税一斗。规定边守军十分三守城，七分屯，内则二分守城，八分屯。全国各共有军屯田八十九万三千顷，相全国垦田总数十分一左右。
除军屯外，有商屯。边守军遇有意外，粮食生困难的候，朝廷“中法”接济。封建皇朝控制着量粮食食盐。但从粮食产运粮边境，运费往往所运粮食的五六倍，费太，极不经济。商人有资本，贩卖食盐利润很，但是食盐是由皇朝专卖的，商人不手。“中法”责商人运一定数量的粮食边境，拿收据就产盐领等价的食盐，由贩卖，从获取厚利。商人是最打算盘的，边境有的是荒，索雇人在边境立屯田，就粮。就省几倍的运费。 在特定的换程中，边军粮食就够吃了；封建皇朝不但省量运费，省了；商人了财；边境荒垦了，增加了生产，建立了许居民点。
在战，虽派有将军做统帅，但朱元璋亲指导攻取方略，根据所军情报实际经验决定前方的行动，即使最亲信的将领徐达、李文忠是此。例，吴元年四月十八日给徐达的手令，在处分军行动，接着说：“我的见识是此。你每（）见高强便处，随你每意见行着，休执着我的言语，恐怕见不处，教你每难行。”洪武三年四月：“说与将军知。……是我中坐着说的，未知军中便不便，恁拣军中便处便行。”给李文忠的手令：“说与保儿、老儿：……我虽般说，计量中不在军中知备细，随机应变的勾，你厮活落些儿，那直我料定。” 洪武元年北伐军，他亲画了征进阵图，派使送给徐达。 提己的意见给前方统帅，说明是参考质，不符合军中实际情况，拣军中便处行着。但是在涉及有关原则问题的候所的命令就很坚决，不改变的了。例，处理降将降官降兵的原则，龙凤十一年十一月初五日令旨：“吴王亲笔：着内使朱明前往军中，说与将军左相国徐达、副将军平章常遇春知：十一月初四日捷音至京城，知军中获寇军及首目人等陆万余众，俘获甚众，难囚禁。今差人前，教你每军中将张（士诚）军精锐勇猛的留一二万。若系不堪任徒，就军中暗除了，不必解，但是头目，一名名解。”十二年三月且严厉责备徐达不杀敌军头目：“吴王令旨：说与总兵宫徐达，攻破高邮，城中杀死军数。头目不曾杀一名。今军淮安，若系便降，系是泗州头目青磨黄旛招诱力，不是你的功劳。是三月已，淮安未，你不杀人的缘故，说将者。依奉施行者！” 元朝降将的处理，更是十分注意，再三嘱咐，吴元年十二月十内接
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