康熙二十二年秋八月，清人既台湾，廷议墟其。靖海侯将军施琅不，疏曰：“台湾北连吴，南接粤峤，延袤数千，山川峻峭，港纡回，乃江、浙、闽、粤四省左护。隔澎湖一洋，水三更。明季设水帅标金门所，泛至澎湖止，水亦有七更。台湾一，原属化外，土番杂处，未入版图。其中国民潜至，生聚其间者，已不万人。郑芝龙海寇，巢。及崇祯元年，芝龙就抚，将此税与红毛，互市所。红毛遂联络土番，招纳内人民，一海外国，渐边患。至顺治十八年，郑功所攻破，盘踞其，纠集亡命，窥伺南北。及其孙克塽，六十余年无不仰厪宸衷。臣奉命征讨，亲历其，备见野沃土膏，物产利溥，耕桑并耦，渔盐滋生，满山皆属茂树，遍处俱植修竹。硫磺水藤，糖蔗鹿皮，及一切日需，无所不有。向所少者布帛尔，兹则木棉盛，经织不乏。且舟帆四达，丝缕踵至，饬禁虽严，终难杜绝。实肥饶区，险阻域。一旦纳土归命，此诚未辟方舆，资皇东南保障，永绝边海祸患，岂人力所致哉。夫方既入版图，民番均属赤子，善计，尤宜周祥。此若弃荒陬，复置度外，则今台湾人居稠密繁息，农工商贾各遂其利，一行徙弃，安土重迁，失业流离，殊费经营，实非长策。况有限船，渡无限民，非阅数年，难报竣。使载渡不尽，苟且塞责，则深山穷谷，窜伏潜匿，实繁有徒，同土番，从啸聚。假内逃军流民，急则走险，纠党患，造船制器，剽掠海滨。此所谓藉寇兵赍盗粮，固较著。且此原红毛所居，无不在贪涎，亦必乘隙图。一所有，彼狡黠，善鼓惑。重贩船，制精坚，从无敌海外。若此数千膏腴，必倡合党伙，窃窥边场，迫近门庭，此乃祸。将沿边诸省，断难晏无虞。至动师远征，两涉洋，波涛不测，恐未易建效。
仅守澎湖弃台湾，则澎湖孤悬海外，土卑薄，异台湾，远隔金、厦，岂不受制人。是守台湾即所固澎湖。台、澎联臂指，沿海水师汛防严密，各相犄角，声气关通，应援易及，宁息。昔日郑氏负抗者，台湾老巢，澎湖门户，四通八达，任其所，我舟师往有阻。今方既我，官兵棋布，风期顺利，片帆至，虽有奸萌，不敢复。臣业与部臣、抚臣议，部臣、抚臣未履其，弃留未决。臣阅历周详，则不敢遽议轻弃。且海氛既靖，内溢设兵，尽陆续裁减，分防台、澎两处。台湾设总兵一员，水师副将一员，陆师参将二员，兵八千名。澎湖设水师副将一员，兵二千名。计兵一万，足固守，又无添兵增饷费。其防守总兵、副、参、游等官，定三年或二年转升内，无致久任，永例。此方初辟，正赋杂饷似宜蠲豁。现在一万兵食，权行全给，三年征，在需。抑且寓兵农，亦济，减省，无尽资内转输。盖筹形势，必求万全。台湾一虽属外岛，实关害，无论彼中耕，犹少资兵食，固宜留。即不毛壤，必藉内輓运，亦断不弃。弃留际，利害攸关。臣思弃必酿祸，留诚永固边疆。是议具疏外，不避冒渎，其利害行详陈。“诏曰。设府一县三，隶福建。府曰台湾，附郭亦曰台湾。南曰凤山，北曰诸罗。澎湖置巡检，设台厦兵备，驻府治，兼理提督、政、按察使、司，分泛水陆，海疆重镇矣。十一月，雨雪，坚冰寸余。
二十三年春，文武皆就任。乃户税亩，有田七千五百三十四甲，园一万零九百十九甲，户一万二千七百二十七，口一万六千八百二十人。琅奏请减赋，旨再议。是奏定则田每甲征粟八石八斗，园四石，每丁征银四钱七分六厘，著例。初，延平郡王功克台岁，清廷诏迁沿海居民，禁接济。至是许海禁，设海防同知鹿耳门，准通商，赴台者不许携眷。琅惠、潮民通海，特禁往。是年建台湾、凤山两儒。
二十四年，建台湾府儒，就郑氏旧址扩，中殿，祀孔子。
春秋丁，行释菜礼。
二十五年，总督王新命、巡抚张仲举奏准，岁进文武童各二十名，科进文童二十名，廩膳生二十名，增广生，岁贡一人。
二十六年，台人始应福建乡试。
二十七年，始铸康熙钱。明太仆寺卿沈光文卒诸罗。
二十八年。
二十九年冬，有年。
三十年秋八月，风，坏屋碎船。
三十一年，停铸康熙钱。
三十二年冬，有年。
三十三年初，修《台湾府志》。
三十四年，知府靳治扬始设熟番社。
三十五年秋七月，新港吴球谋，不，被杀。
三十六年，仁郁永河始至北投煮磺，遍历番社。
三十七年。
三十八年春二月，吞霄土官卓卓雾亚生乱。夏五月，淡水土官冰冷亦应。秋七月，水师至淡水，执冰冷杀。八月，署北路参将常泰岸番击吞霄，禽卓卓雾亚生归，斩市。
三十九年，诏赐明延平郡王郑功及子经归葬南安，置守冢，建祠。
四十年冬十二月，诸罗刘却，毁茄苳营，附近熟番亦乱。伐，却败走。
四十一年。
四十二年春二月，刘却复谋，不，被杀。
四十三年，建崇文书院。
四十四年冬，饥，诏蠲三县粮米。
四十五年，建诸罗县。
四十六年冬，饥，诏蠲粮米十分二。
四十七年，泉州人陈赖章与熟番约，往垦佳腊野，是辟台北始。
四十八年。
四十九年，始设淡水防兵，定三年一换。
五十年，建万寿宫府治。
五十一年，诏蠲本年租谷。
五十二年，诏五十年丁册准，滋生人口，永不加赋。北路营参将阮蔡文亲赴竹堑、肚诸社，抚慰番黎。
五十三年夏，郡治太火，毁数百户。秋旱，诏蠲台、凤两县租谷十分三。是年命主教神甫买剌台，测量经度。
五十四年，总督满保奏言：“台湾远属海外，民番杂处，入版图，所有凤山县熟番力力等十二社，诸罗县熟番萧壠等三十四社，数十余年，仰邀圣泽，俱各民安物阜，俗易风移。今据台湾镇详报，南路生番山猪毛等十社，四百四十六户，北路生番岸等五社，四百二十二户，俱各倾向化，愿同熟番一体内附。每年各愿纳鹿皮五十张，各折银十二两，代输贡赋，载入额编，就台充饷。此外不丝毫派扰，彰怀远深仁。”诏。生番内附。
五十五年夏五月，福建巡抚陈璸奏言防海法，岸社土目阿穆请垦猫雾拺野，诸罗知县周钟瑄许。是辟台中始。
五十六年冬，饥，诏蠲本年租谷十分三。
五十七年。
五十八年初，修《凤山县志》。
五十九年，建海东书院。冬十月朔，震。十二月八日，又震，凡十余日，坏屋杀人。诏免番民银米。
六十年夏五月，朱一贵冈山，破府治，总兵欧阳凯、副将许云皆死，南北俱应。一贵称中兴王，建元永，复明制。总督满保闻报，驰赴厦门，檄南澳镇总兵蓝廷珍兵，水师提督施世骠伐台。六月，克鹿耳门，迫府治。一贵战不利，被禽，械至京，磔，余党亦渐平。八月，风坏民居，尽赤，军民溺死。诏蠲征谷，帑振恤。廷议移台镇总兵澎湖，设陆路副将府治，裁水陆两中营归内。廷珍力争不，书满保止，提督姚堂亦言，乃罢议。特命满、汉御史各一员，岁巡台湾，察民疾苦。
六十一年夏五月，御史吴达礼、黄叔敬至京师。满保沿山一带，易藏奸宄，命附山十内民居，勒令迁徒。北路至南路止，筑长城限，深凿濠堑，永界，越界者盗贼论。廷珍复书止，乃饬沿山各隘立石界，禁民深入。是年阿山、水沙连各社番皆就抚。夏，凤山、赤山裂，火光丈余。
雍正元年，诏曰：“台湾古不属中国，我皇考神武远届，拓入版图，末年朱一贵倡乱，攻陷全台，诸臣夙禀方略，士卒感戴教养恩，七日克复。
皇考春秋高迈，威播海外，所有立功将士，其各加等议叙。“是增设彰化县及淡防厅，升澎湖巡检海防同知，添置防兵，守南北，台湾局势渐展矣。是年傀儡番乱，讨。
二年，诏蠲康熙十八年至五十年各省旧欠银米等项，给台湾换班兵丁眷口粮。是年初，修《诸罗县志》。
三年，诏豁番妇丁税。
四年初，台湾盐，归民晒，但征
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