1949年，钱穆随华侨迁至香港，从此，钱穆就始了孤悬海外、与人音讯阻隔的半生。
钱穆的素书楼庭院，特意植了乡的植物：苏州紫竹。
1949年钱穆选择离陆，但他故土一直怀着深深的眷恋。钱穆80岁，在夫人陪同南游，写《八十忆双亲》，缅怀父母养育、教诲恩及兄长扶掖、帮带情，透露陆亲人的眷怀与思念。又写《师友杂忆》一书，他的师友往、著旨趣、生活路了全面、平实的回顾。
钱穆晚年在《八十忆双亲·师友杂忆》中乡的山水记忆犹新。1914年1915年的一年间，钱穆每周坐船往返无锡梅村、荡口两镇。水乡泽国的丽景色不仅让年轻的钱穆情激荡，让他读书日益精进：“余坐船头，读《史记·李斯列传》，千古，恍目前。余读书，又获深入新境，读此篇始。”所，钱穆在的读书写，必选清净处。
40年间，钱穆与子女有四次相聚，分别是1980年、1981年、1984年、1988年，每次长则月余，短则一周。点则在香港。其情景颇让人联监牢探视。
1980年夏，钱穆在夫人陪同香港与阔别三十二年久的在陆的三子（拙、行、逊）一女（辉）相见，欢聚一周。钱穆相责子女尽责任，幼女因他的缘故受委屈，格外感愧疚。
未料次团圆一年半，长子钱拙即因淋巴癌世，钱穆回台又面临外界质疑他是否已返回陆探亲。
1984年，钱穆90岁，在港门人举行寿庆活动，先生与二子、二女及孙（松）孙女（婉约）团聚了一月，享受伦乐。
1990年6月1日，钱穆先生不满身立法委员的陈水扁与台北市议员周伯伦指控他霸占政府建筑物，九十六岁高龄身毅搬离素书楼，却因此情不畅，在生命最的3月，素书楼庭园内的树木始终萦绕在他的脑际，清晨，他总是望着窗外问夫人：“树呢？树怎不见了？”
眼疾缠身的钱穆，搬已不太门，不太肯讲话进食，记忆力明显减退，仅希望子女在他生前台一聚。但不从人愿，终在度九十六岁的寿诞，就是迁素书楼才3月的钱穆，魂归山。
1990年8月30日晨，台北风雨。9许，钱穆在台北杭州南路寓所平静走完了生命的最一刻，享年96岁。他有西方基督教所幻的国，有佛教所希望的涅槃的彼岸，是魂归祖国母亲温暖的沃土中。
9月2日，远在北京的冯友兰向台北钱穆中唁电一封。
钱穆故，李登辉台湾领导人身分亲往致哀，属订9月26日在台北举行公祭，子女亲属奔丧却又引风波。钱穆生有三子二女，但皆在陆。1990年9月2日，知父亲世的消息，次子钱行、三子钱逊，长女钱易、幼女钱辉遂申请赴台奔丧（长子钱拙20世纪80年代患癌症世），参加9月26日在台北举行的公祭。但由两岸关系的原因，遭拒绝。台湾局甚至“公宣布离共产党”条件挟钱穆的胞侄钱伟长（全国人副委员长）。无奈，钱氏子侄赶赴香港，参加9月30日在香港新亚书院举行的公祭。
钱穆死前曾有遗嘱：果人不回（指回陆故乡），葬回。了完钱穆魂归故的遗愿，钱夫人胡琦将丈夫的灵骨一直安放在台北永明寺，等待着归葬陆。
钱穆江苏无锡人，他逝，骨灰被送回乡安葬，实现了他回归故土的遗愿。
1991年两岸关系终始松动。1992年1月6日，胡琦在素书楼弟子辛意云先生邵世光姐（曾任钱穆的秘书）的陪同，护送灵骨由台北经香港飞海，傍晚达苏州。
1月8日，在灵岩山寺做了一安魂法。晚，灵骨被运西山入室。气晴雨。
1月9日，是既定的安葬日期。从人愿，终放晴了。葬礼午11正式始。墓中的随葬品是一包书。钱穆一生著述54部，计1700万字，包书是从些著中选的14。葬仪传统祭礼仪举行。
参加葬礼的孙辈，除了孙女婉约外，有见祖父（外祖父）。胡琦特意安排辛意云给钱氏子孙讲述钱穆的人与术。
至此，钱穆先生归葬太湖西山俞渡石皮山。
钱穆世，钱夫人及二三门人搜集、整理的一千七百万言《钱宾四先生全集》三编（甲编：思术，乙编：文史术，丙编：文化论述）五十四巨册，1994年～1997年由台北联经版公司版。