章太炎投身革命，其师俞樾甚是反。章苏州东吴任教，前拜望老师，俞樾怒，怒斥章：“闻游台湾，尔隐，不科举，隐，则梁鸿、韩康。今入异域，背父母陵墓，不孝；讼言索虏祸毒敷诸夏，与人书指斥乘舆，不忠。不孝不忠，非人类，子鸣鼓攻！”章不服，曰：“弟子治经侍先生，今经，渊源在顾宁人。顾公此，正使人推寻国，识汉虏别耳，岂刘殷、崔浩期生？”遂写《谢本师》一文，表示从此与俞樾断绝师生谊。刘禺生在《世载堂杂记》中记载：“章太炎创革命排满说，其本师德清俞曲园先生不，曰：曲园无是弟子，逐门墙外，永绝师生关系。太炎集中，有《谢本师》文。”
虽因政见不合，章太炎与本师闹翻，但他内老师依十分尊重。章很喜月旦人物，并且少所嘉许，但终生老师俞曲园谭仲修二人极尊敬。曾国藩曾说俞樾是“闻人”，章闻勃怒，驳斥：“先生虽广涉群书，先务有所在，与夫泛滥记诵无所归宿者固殊矣！”
金尧曾记录章太炎老师俞樾的维护：“有一次在西湖的某处，跟梁启超等在一，梁氏见前面挂的一副俞氏所撰楹联，就讥讽说：‘喔，原是一鹁鸪！’章就闻恚甚，动武了。”
俞樾世，章太炎亲撰《俞先生传》，虽不无微词，但通篇充满敬意，曰：“浙江朴晚至……昌先生。”章太炎定《太炎文录初编》，并有收录他的《谢本师》，倒收了晚年写的《俞先生传》。此，李肖聃在《星庐笔记》中章太炎尊师举予表扬。有人据此称章太炎谢本师是在政治保护老师。
章太炎晚年游杭州，晨特穿长衫马褂，又生陈存仁章次公同穿戴，并命他带着香烛水果，“曲楼”凭吊老师俞樾的故居。曲楼前，一位老妪前应门，章抬腿就往面走，老妪问他是谁，双方一语不合，老妪便举扫帚逐客。三人无奈，在门口等着。约等了两辰，曲楼才门，一位姓陆的中年人，章太炎说明意，陆某告知曲楼早已易主，并让他进楼祭拜。春在堂前，章命陈登点香烛，行三跪九叩礼，俞樾尊敬故。陆某在旁呆了。章本留几字，但因主人有笔无纸，章便在墙题诗两首，黯离。
章太炎曾《谢本师》一文与老师俞樾断绝关系。章太炎依附孙传芳，他的生周人亦《谢本师》一篇，与章断绝关系。抗战中，周人附逆，水了汉奸，他在北的生沈启无亦《谢本师》，与他绝。
据许广平回忆，因章太炎提倡复古，鲁迅其很不。但鲁迅提章，依非常尊崇，总是称呼“太炎先生”。章太炎晚年的行，公允的评价——既有批评，但不改敬意。1936年6月14日，章太炎逝世；已经病重的鲁迅，10月6日10月17日连续写了两篇文章《关太炎先生二三》、《因太炎先生的二三》。两的10月19日，鲁迅世。在两篇文章中，鲁迅太炎先生曾经给予他的积极影响表示感激，太炎先生在革命史的意义表示赞赏。
1933年6月18日，鲁迅在给曹聚仁的信中提章太炎说：“古师，实在太尊，我此颇有反感。我师荒谬，不妨叛，但师非罪遭冤，却不乘机石，图快敌人意救。太炎先生曾教我，因我主张白话，不敢再见他了，他主张投壶，窃非，但国民党收他的几间破屋，我实不向局媚笑。相见，仍执礼甚恭（太炎先生弟子，向绝无傲态，蔼若朋友），师弟，此已矣。”
已经93岁高龄的姚奠中一提乃师章太炎，立即显肃严。姚说章太炎老师其生求甚严，一丝不苟，姚老治授业打良扎实的风基础。谈章太炎老师的晚年，他讲章太炎老师在1936年6月14日午正在讲解《尚书》，实感闷，萎顿教室中，俄尔即仙。此姚已黯泪，哀叹嘘余，豁身，直至书案提笔写：“正己本，从义怀，博知，勇决行，世归。”他接着说：“就是我老师章太炎先生一生的写照，是我的座右铭。”