1946年4月，抗日战争胜利，北、清华、南三校准备北复员，并决定在原址留碑纪念。五月四日，西南联师生在图书馆举行结业典礼，校园山举行“国立西南联合纪念碑”揭幕式。碑文由西南联文院院长冯友兰教授撰文、中国文系闻一教授篆刻、中国文系主任罗庸教授书丹，被称“三绝碑”。冯友兰写的《国立西南联合纪念碑文》被公认与陈寅恪纪念王国维的雄文比肩的文章，被史何炳棣融古烁今的“至文”、“不朽文章。”
二十世纪四十年代，国民党独裁统治招致民怨沸腾，党内求实行民主、宪政的呼声非常强烈。国民党西南联区党部就召议，公推冯友兰致信蒋介石，求国民政府收拾人实立宪。信中写：睹一叶飘零，知深秋将。昔清室迟迟不肯实行宪政，致失人，是本党功。前不远，殷鉴。据说，蒋介石罢“动容，泪”，不久，复信西南联，表示同意信中求，实行立宪。
冯友兰中国的未充满希望，他在联碑文写中国“并世列强，虽新不古；希腊罗马，有古无今。惟我国，亘古亘今，亦新亦旧，斯所谓周虽旧邦，其命维新者！”
万长征，辞却了，五朝宫阙。
暂驻足，衡山湘水，又离别。
绝檄移栽桢干质，九州遍洒黎元血。
尽笳吹，弦诵在山城，情弥切。
千秋耻，终雪。中兴业，需人杰。
便一三户，壮怀难折。
难殷忧新国运，动忍希前哲。
待驱除仇寇，复神京，燕碣。
冯友兰执笔写就西南联校歌：
1939年秋至1940年春夏，陈立夫教育部部长的身份曾三度训令联务须遵守教育部核定应设的课程，统一全国院校教材，举行统一考试等新规定。此项训令的目的是加强蒋政权高等教育及高知的思统治。联教务议致函联常委的方式，抵抗驳斥陈立夫的三度训令。封措辞说理俱臻至妙的公“函”的执笔者舍冯友兰莫属。