从苏联回国，冯友兰先生根据己的所见所闻了两次正式演讲。一次是漫谈苏联见闻；另一次是在北哲系，“秦汉历史哲”题，提了历史唯物主义的某些思基本素的“新三统五德论”，集中论述了社存在决定社意识，社意识反社存在的观点。
次讲演引了官方的怀疑与不满。次年十月底十一月初，他竟被国民党政府警方视政治嫌疑犯予逮捕、审讯。国民党此举引全国哗，人纷纷提抗议。迫全国的民主势力，冯在被关押、审查数，遂被释放。次件，鲁迅先生曾在一封书信中愤说：“安分守己冯友兰，且被逮，推知其他了。”（《鲁迅书信集》）次件冯的震动颇，但他并未因此与国民党决裂，是选择了更加谨慎微的路。
冯友兰先生的境界何其难，比友金岳霖的不问世，他的经历艰辛坎坷许。冯友兰的女儿宗璞觉：年，父亲冯友兰受各方面的批判、谩骂打击，众矢的，却不疯不杀，仍在他的哲遨游，真是非常勇敢，非常了不。
冯友兰一次与毛泽东接触，是1949年10月。有许人向毛泽东写信表态效忠，他写了一封信，意说：我讲封建哲，帮了国民党的忙，现在我决改造思，习马克思主义，准备在五年内马克思主义立场观点、方法，重新写一部中国哲史。
1949年冯友兰一直就在被改造中，是最的改造象，因他有思。张岱年就说，冯先生位特殊，不仅有“言”的由，甚至有“默”的由。
1951年，冯友兰随中国文化代表团访问印度，印度总统普拉沙德介绍冯的术贡献曾提及《中国哲史》《贞元六书》。外部知立即致电代表团，说此介绍有问题，求冯适机更正。此，冯友兰在加尔各达访问，在演讲中应外部的求说：“中国革命功，我认识我的著是有价值的。”
50年代，在思改造运动中，冯友兰次检讨待，甚至不惜纲线，有说无，但是主持人就是不让关。金岳霖由素与政治无涉，在运动中关较快，不久被树积极分子，组织让他冯做工，帮助冯转变。一进门，金先生就声说：“芝生啊，你有什不人民的方，彻底代呀。”说着，扑冯友兰抱头痛哭。
文革中，工宣队进驻北，很教授被隔离审查，俗称“蹲牛棚”。教授一切听指挥，早请示晚汇报排队，排队必须报数，同报己的政治帽子，冯友兰头较高，曾被叫排头一，并叫他说：“报数！我叫冯友兰！是……是反动术权威。”红卫兵说：“不行！重报！你是避重就轻！你是反动阀！”冯便改口：“我，我是反动阀。”洪谦先生由害怕，怕说他避重就轻，就说：“我叫洪谦，反动阀！”红卫兵说：“不，你不够格，你是反动术权威！”洪吓连忙改口。冯定报“反动术权威”，红卫兵说：“你不就是写一本《平凡的真理》？你往反动术权威钻！你是反革命修正主义分子！”
冯友兰在牛棚受折辱，但他饭照吃，觉照睡，其早餐是一窝头，两碗玉米面粥，一分钱的咸菜丝。咸菜不少，一般人吃不完，唯冯友兰不够。经郭兰芳提醒，冯着胆子向红卫兵两分钱咸菜，红卫兵瞪眼睛说：“人一分钱咸菜吃不完，你吃两分钱的，你怎吃？”冯答：“我……我吃的。”话虽受斥责，竟满足了求。洪谦与冯友兰子差不，饭量有冯友兰的四分一。
71岁高龄的冯友兰，仍有人抄，搬凳子搁院子，他站在面。贴满了打倒的标语字报，铺盖，处贴封条。衣服封了，冷了，封条不敢拆，冯友兰就披条麻袋御寒。他的输尿管不通，腰挂着尿瓶，被拉批斗，打倒在。游街连连跌跟头，是继续走。了斗他，甚至立了批冯联络站。
冯友兰幼子冯钟越先生是航工业部主任工程师，有名的飞机强度专，惜不假年英年早逝，赍志终才51岁。他长年工在西北黄土高原，按照冯友兰的声望冯钟越的才，果活动活动，调回北京应该是做的。但在人眼中有点傻气的冯老却有做。幼子的逝世，冯老是含泪题联：“是党员，是干部，壮志未酬，洒泪岂止痛；娴科技，娴艺文，全才罕遇，招魂难再归。”
冯友兰在人生最的几年，住院的频率更频繁，几乎是女儿女士陪着他在各医院打游击战。他的旧病丹毒复很频繁很厉害。丹毒是皮肤及其网状淋巴管的急炎症，其部位一般是肢面部，冯老的丹毒主在肢。除了丹毒外，1983年现冯友兰患有浆细胞骨髓瘤，并且是恶，所他的健康状况使宗璞夫妇非常担，且人老了，身体容易犯毛病，宗璞女士一般定期陪冯老做检查。冯老却在情况完了150万字的著述，除了他顽强的生命力外，与宗璞夫妇冯老的悉照顾关是分不的。