研究人员招聘了，研究方向确定了。研究院定有两的方向—智人机界面一代媒体技术，另外，张亚勤将继续在数据压缩、视频、高清晰度电视互联网等领域研究。研究院的工很快就步入了正轨。
在国的候，张亚勤全面负责桑纳福研究院媒体组的工，所有决定几乎由他做，他是绝主角。现在，微软中国研究院的首席科，他变了一配角，职责是协助李复制定并不断修正微软中国研究院的研究方向选题，健全研究院的组织机构，并在研究组间进行协调。
张亚勤刻有忘记他在国的老板他说的话，“你回，有功，很有被边缘化。”张亚勤随口回答了一句：“我年轻，才30岁，试试，不我再回。”不张亚勤从有打算“做不了就回”，那不是他的风格。他说，既选择了，就有退路。
创立初，研究院的人说，新生的机构必须拿点儿什东西证明己在世界科研版图的存在，才谈一步的。那候，张亚勤的人有回国，他真正了一“公司人”：白面试、定方向、讨论课题，晚一吃饭，接着关在办公室搞己的课题，神经实在绷紧了就打保龄球。每晚差不11点钟才离办公室。周末偶尔稍微休息一。就是在那段住香格拉酒店公寓的间，张亚勤系统复读了很武侠说。就，一周七沉浸在激情：“完全就像搞一新公司一。一着一定做绩，让我在中国比在国更功。”
1999年5月，盖茨派微软首席技术官克雷格·蒙迪北京考察微软中国研究院的进展情况。是克雷格·蒙迪一次中国。张亚勤跟位CTO是老相识，两人在竞争国高清电视标准就是手。张亚勤评价位曾经的手“相厉害”。正所谓“不打不相识”，现在了同，聊更投机了。
克雷格·蒙迪此行是考察，给些新员工打打气。他最新团队在几月做了什新果。在研究院外外转了一圈，克雷格·蒙迪眼界，回总部，他向比尔·盖茨汇报：“中国研究院的那些人真是厉害，在中国的平台，居吸引了一批优秀的人才。”
总部的肯定让研究员信增。但张亚勤他很清楚，真正立足的资本不是鼓励，是战果。研究院全力赴，几月就有了效。
1999年11月5日，微软中国研究院在北京庆祝立一周年。在短短一年中，不仅研究机构初具规模，且在术研究方面取了累累硕果。研究人员由最初的两人展60人，在国际一流刊物表论文28篇，并版了微软中国研究院的一本论文集。
2000年，张亚勤回国刚一年的候，IEEE视频杂志最佳论文奖获者揭晓，张亚勤再次折桂。专业奖每年有一位获奖者，项殊荣的研究院意义重。颁奖典礼，主持人介绍获奖者张亚勤说，“He is from a！（他中国！）”台听众始头接耳议论。
站在领奖台的张亚勤不像往领奖那一脸淡定，此的他正努力压抑着己的喜悦。他双手接奖杯，高高举，向台的嘉宾致意，此，泪水在张亚勤眼打着转。
张亚勤并不是一次的奖项，他不是容易激动的人，但他听那句“from a”的候，中一子就涌一股暖流，鼻子酸。他的中意识：“句‘中国’至少说明了两问题：一是我一次真正代表着中国；再就是证明了我并有被边缘化，我打破了其他人回国做科研、我的悲观论调。”
张亚勤有资本豪。一年，研究院取了丰硕果，本土研究员实习生长迅速。仅他领导的媒体组就在全球最优秀的术刊物议表了80篇论文，在网络协议领域申请注册了40项专利，做了60项新明，并已有8项熟技术转让给微软公司的相关产品部门。