任命案公布不久，清华生代表刘汉文、林文奎、汪镳便赴南京请愿。蒋介石教育部长的身份接见了3位请愿者，他与3人扯了一儿闲篇，几乎听3人的申述，便说你的意见我已知，吴南轩先生已经告诉了我。希望你回转告一清华的生，你的主任务是习，我的主任务是管理校政，我保障你的习，请你不妨碍我的决定……
3位南请愿的生又见了吴南轩，显，由蒋介石定了调，吴南轩除了“谢主隆恩”外，强化“党化教育”的理念。他谈了几点意见：
（一）将遵照蒋主席的整饬风的意旨及教育部所核定的长期展计划，无畏精神、稳健步伐执行。
（二）在认识方面，将本着公无态度，推诚相见，绝不玩手段：“人重品才，无派别门户见”，不带人，不轻易更动现职人员。
（三）治方面，将严守法治精神，不徇情破坏法制，欢迎师生积极建议，将公态度，择善从。
（四）注意校的均衡展，绝不偏颇。
（五）清的最希望是，提高科程度，养浓厚的研究风气，注意培养生的人格，“务使清现代式重智的外，兼备吾国古代尚德教育的风”，使人才辈，完党国培养人才的使命。
（六）生，强调“同应注重身德的修养，少分注意校行政方面，盖校行政，应完全由校长负责”。
吴南轩的6条意见中，最一条最一句是关键中的关键：“盖校行政，应完全由校长负责。”一句话，使的教育倒退了许年。
1912年，任教育总长的蔡元培建议引进德国教育模式，并1919年在北率先设立“评议”、“教育”，教授参与决策与管理的观念便深深植根清华的教授中。项制度所在清华坚持完善，清华的教授族群数欧的背景有很关系，特别是清华的“少壮派”，他数在国完了高等教育，国式的民主由等社价值观不知不觉他社单位的判断尺度审标准。他尊崇的是术独立，由思，他排斥的是独断专制，党同伐异。他在社的坐标往往呈现一隐形的轮廓，甚至像气体般柔软，像体般流动，但有候却比刀刃更锋利，比钢铁更坚硬。他被挤压，或许变形，甚至服从，却不从底服膺。因此，蒋介石委任吴南轩清华校长，清华的教授在一间内考虑的并不是拥护不拥护，服从不服从，是他己的标准衡量吴南轩，他适合不适合，符合不符合清华园的传统思。
在清华人，吴南轩资质平平，并无术位，并非蒋介石所说“识极优”，让一平庸却拥有极政治权力的人长校，清华无疑是一戕害。他的校长治校方略，则是推行专制的信号，校长一人说了算，封建社皇帝一人说了算有什两？
尖锐的立再次浮水面。
次与乔万选的决，其身是国民革命军京津卫戍总司令阎锡山；一次与吴南轩的决，其身是国民革命军总司令蒋介石。靠山一比一硬，一比一。
但清华园并不屈服。
从罗伦辞职，叶企孙便代理校长的身份现，虽委任代理校务的有冯友兰，但罗伦一走，一些生因冯友兰的北背景，屡屡与冯郭廷纠缠，冯氏便不不退辞。，在段特殊期，叶企孙不不站在清华艘夜航船的最前端，接受着风口浪尖的考验。
1931年4月16日，吴南轩在清华就职。其仪式一罗伦就职典礼，北平党政军警代表悉数光临，放气球，奏军乐，热闹非凡。吴南轩在致辞，公宣布己的使命是“党国培养人才”，给人的感觉比罗伦更罗伦。
此的叶企孙，正在欧洲休假，就在吴南轩粉墨登场，他吴宓正在湖泛舟游览。
四月十六日（thursday）
晨，雨。由hotel
ver（territet）窗中外望，湖山水，浑沦一片，深青色，雪山云所断，云更由山顶，绚丽吐烟，色皆青白，比昨夕更饶幽韵。诗一句，足昨稿。
晨餐，仍微雨。与企孙，乘电车（0.30franc）西行，沿湖滨，约十分钟至一刻，抵clarens（译音克拉朗）……（《吴宓日记》1930-1931卷，252-253页）
吴宓此正在法国巴黎休假，叶企孙的术休假是在德国的哥廷根。按照校规定，他将在进修一年。二人相约日内瓦湖游玩，是方有吴宓日记中记述的4月16日行。
一月前，吴南轩尚在南京，曾给远在德国休假的叶企孙拍了一封电报。电报，吴温婉的口气请求叶企孙否暂缓休假，回国与其“共襄校务，援助力”。吴南轩知叶企孙的术位崇高人望，若获他的支持，清华的诸问题或许迎刃解。吴南轩本是狂傲的人，中央政治校副主任的经历蒋介石的台使他有些飘飘。但在叶企孙面前，他是己的姿态放低了一些。他耐住子在电报说了一些软软的话，甚至有些低声气。他更保险，叶企孙本是谦的人，常言说伸手不打笑脸人，我礼贤士，况且有蒋总司令的依仗，面子他总给吧？
哪料，叶企孙真狠狠驳了他的面子。
叶企孙回复说，正在课题中，实难从命，冷冷回绝了他。
叶企孙的不合态度在清华边引了不的反响，在很程度影响了许持观望态度的教授生，他纷纷加入不合的阵营，向吴南轩公叫阵。
吴南轩任伊始，就秉承蒋介石的意志，独揽权，实行校长专制，取消“教务”“评议”的诸权力，擅任人亲信，将各系、科室主任全部撤换等等，一引全校师生的公愤……
叶企孙又给了吴南轩二次打击。
就在吴台不久，他法院院长陈岱孙、文院院长冯友兰相商，突集体宣布辞职，并在京津媒体予布，一驱吴运动的导火索。
5月28日，清华教授通决议，公推萨本栋等7人组呈教育部电文草委员，谴责吴南轩“唯务权独揽，不图展术，加蔑视教授人格，视教授雇员”，并致电蒋介石本人，求他“另荐贤”，若问题不解决，“全体教授定年与清华离关系”。
5月29日，生召全校生，表示坚决支持教授决议，求撤换吴南轩。生干部组织生整队环列校长住宅，高呼驱逐口号，命令其即离校。
吴南轩在四面楚歌中离了清华，他带着校印逃了市内东民巷利通饭店，一遥控办公；二切断清华的经济源，迫使就范；三逃躲风头，等政府面弹压；四制造舆论，反诬教授“唆使生，胁迫校长”等罪名，寻求社的支持。
清华师生此针锋相。生召紧急，决定组织护校委员，表声明说“倘吴借武力校，决武力护校，准备流血”。教授立校务维持，并选派代表南京教育部请愿。
吴南轩终不敌，他身的国民党政府无奈何。6月25日，吴南轩带着悲凉郁怨的情离了北平，行前表宣言，表示清华人的极度失望——
教授治校，原有采，不其精义在集中治方面，养纯粹研究术精神，不在领导生干预校政，推倒他人工具，造“生治校”、“校长不治校”、“教授不治”风气。
吴南轩走，南京政府再不敢随意染指清华。蒋介石似乎正忙戡乱南方“匪”，无暇顾及陡生变的北国清华。教育部在驱吴风潮平息，是草草传一纸任命，委派清华教授翁文灏“暂代校务”。翁文灏曾是叶企孙任理院院长聘的系教授，鉴校内问题棘手，忙南京质调查所的务由，不久就辞了任命。教育部又急招叶企孙回国，委任他清华代校长，主持清华校务。
是叶企孙二次任清华代理校长。
叶企孙再次主持校务，使他企盼梅贻琦长校的情又强烈。有一的教书育人环境，群龙无首的局面显是不行的。尽管南京国民党政府推行党化教育的力度将逐渐加，但在某些特殊区域，恪守人的信念，真正推行术独立，专治校的理图景是局部实现的。了达目的，他迭递辞呈，给教育部施加压力。他在一封电文说，“校务万端，非企
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