1954年秋，中国科院立中国科史研究委员，并在历史二所内设立科史组，建立独立的专业科史研究机构准备。科史研究委员主任由中科院副院长竺桢先生担任，负责全面工。叶企孙先生历史侯外庐先生副主任，因侯先生忙已往的研究，管很少，一，委员的具体工就落在了叶企孙的身。
从领导岗位退，叶企孙似并无不适。他每周有两历史所班，班的候，他比校课间提前一。他在北校门口乘公共汽车，了动物园，再换乘东城的公共汽车，有座无座，他倒不在乎，他在乎的是一定按走进历史研究所班的人流中。他已经56岁。他三十岁的候就已经有了人汽车，那在清华应该算头一份，他那的月薪400元，在教职员中是数一数二，折合现在的人民币该有四五万元，因有室累，手头就显宽绰，即使是校长梅贻琦，因子女甚，有他生活优越。七七变，他汽车卖了，在津的候又些钱捐给了冀中。解放他的工资有四百元，甚至比的国主席毛泽东的工资高。现在年纪了，本应该有车的候却倒了儿，但他似乎并有在意些，且往深处，车竟有诸的处。
是变化。
他认是改造思的结果。
在北前，他认清华的思改造运动应该算是“波澜壮阔”了，但了北，才知是井蛙见。北在思改造运动，马寅初曾给周总理写信，特聘毛主席、周总理、朱德总司令等十人北政治习的辅导老师，毛泽东夸奖说“习很”，见北“洗澡”颇领。紧接着的“忠诚老实”运动，北搞有声有色，连一些人曾“宪兵一月”的历史问题被挖了，见运动力度。不仅此，因“习苏联先进经验”，北始聘请一批苏联专教授，在教材推苏联教本，在全校232教材中，苏联教本52，占1/5。文所已始批判胡适派资产阶级唯主义思，中文系已始批判俞平伯研究《红楼梦》的错误观点。哲系召报告，庆祝斯林《马克思主义与语言问题》版。校领导在说：“促进科的展，必须在术界清除资产阶级思，保证科在马列主义的思指导向着正确的方向展。”（《北京纪》，北京版社1998年版，486页）
在的环境，叶企孙既释又惑。一方面，他真的认己确实有需改造的方，就像有人说的“洗澡”，所“洗”，是身有灰，有泥，有新陈代谢的分泌物，洗一洗，搓一搓，水一冲，干干净净，清爽透亮，轻装阵，什不。抱着的理，抱着接受新生物的态度，他真的是严律己，真的认己是有“原罪”的，他是真的搞批评联系实际，联系己的。
比每坐公共汽车班，从西郊东城，松动一筋骨，舒缓一情，换换背景，接近一人民群众，体察一老百姓的日常生活，改变一思感情，与新中国同同德共同前进，是他所乐意希冀的，他感觉己的适应像春的植物般一节节生长，他他是进步的。
让人惑的是另一方面。什空气中总有一紧张感不安感？“洗澡”什总喜欢搓泥搓血？他就不懂了。果一人有病，医生不是了他治愈，是了他治死，是什？什在人群中有那人制造的不平、冷漠、倾轧、逼仄、促狭、猜疑、嫉恨、仇视、诋毁、虐待，甚至戕害，什不宽松、平静、温润、谦让、礼貌、相爱、安适、、诗意及谐呢？果说习改造是一辈子的，什不从长计议非搞疾风暴雨呢？一运动接踵，密密麻麻，无边无际，让人惶恐不安，人人危，了什呢？人活着是了运动是了创造？的环境有利聚精神搞科吗？他是一教育，他并有使苏联教材，不是培养诸的人才吗？他并不一味排斥苏联教材，是未经实践检验的东西怎就一股脑儿全部照搬呢？他是一重实验的物理科，凡有经实验的东西存疑，才是科应有的态度。他不通的有，搞科什“清除资产阶级思”扯关系？科展非清除资产阶级思吗？什是资产阶级思，些抽象的东西不见摸不着，却终年累日与它，值吗？什人计算一国本？就联系己实际讲，他一类知识分子，算资产阶级吗？一无资产，二无资本，三无资金，唯物主义观点讲，将“三无”人硬扯进资产阶级队伍是不是最的唯主义？至资产阶级思，就更难捉摸。经济基础决定层建筑，是马列主义的一贯思，既己是“三无”的，岂产生资产阶级思？若说己的思结构，既有资产阶级的又有无产阶级的，有封建阶级的，既有传统的有现代的，既有保守的又有进步的，它杂糅错纵横密织，很难剥离，并且刻刻受环境的影响，很难非黑即白概括，即使硬扯进“资产阶级思”，失简单偏颇。己此，别人亦。既此，何在无休止引入政治运动思斗争？
他不通。
他所每周进城班，除了科史本身的吸引力，有躲清静的意思。从史料知，此的北正迅速向“先进的社主义”迈进，从1952年1958年，仅从语义词源意义研究段期的北语言，凡是“文革”中现的词汇，若找处的话，十有八九诞生在。正是些新语言新思维，新措施新行动，像胚胎般在北育长，长了北式的“文化革命”，才经伟人手推广全国。说是毛泽东动了“文化革命”，但明权却在北。北是“文化革命”的策源诞生，北一现红卫兵组织、现聂元梓类的造反派，绝不是偶的。
一“先进的社主义”办目标的，却了“文化革命”的策源，人深省。
一有着众“资产阶级术权威”的清华却培养了诸新中国的栋梁才，令人深思。
至今，经院校调整的北京清华，已经走了半世纪。两所加的术果优秀人才难与年叶企孙的清华理院果相比。有台湾者苏云峰先生提供的有关资料——
清华理院的就（1929年-1947年）
理院毕业生共515人，有资料者381人，其中，在中国陆者311人，中国台湾29人，国35人，中国香港6人。其共同致力科基础研究，及工业国防科技的应展。在国防科技方面，中国清季强运动所追求的“富国强兵”，“富国”一直落实，“强兵”至六七十年代才告落实，“两弹一星”就完在批清华理工两院生手。在理化生物质等基础科研究领域，比20世纪前半叶进步。杨振宁、李政获诺贝尔奖，更加强了中国人的信。
物理系毕业生在中国陆者68人，国3人，中国台湾2人，中国香港1人。在陆者有18人中国科院院士。“中国氢弹父”的王淦昌，“中国导弹父”的钱森，即在其中。让我进一步叙述他的表现。
王淦昌（1929级）代中国实验原子核、宇宙线基本粒子研究的主奠基者拓者。60年代初任核武器研究院副院长，与清华的一些科彭桓武、邓稼先（1945级，甚杨振宁首肯）等人，完研制一颗原子弹的“596工程”至今影响陆科展的“863计划”，其中包括核计划，王被称“中国氢弹父”。钱森（1934年清华留公费）是国著名航空工程专，爱国故，放弃在崇高位，回中国展航空业。曾任国防部五研究院院长，七机械部副部长，从飞弹研制培养人才的工，中国展火箭等新武器有极重贡献。参与钱森研究计划的清华理工院毕业生甚，其中被选中国科院院士的有：彭桓武（1936级），数物理部院士，主持中科院近代物理所。钱三强（1936级），数物理部院士，二机部副部长兼原子研究所所长，现“核反应三裂变”，是中国原子业创始人一。另外，参与筹建中科院及其各部，培养人才。何泽慧（1936级），数物理部院士，从核子物理研究，参与核武器的研制。龚祖同（1930级），技术科部院士，是中国最早光仪器研究设计人一。傅承义（1933级），部院士，是中国球物理科主奠基人一。翁文波（1934级），部院士，
（本章未完）