9月25日，10兵团完了漳厦战役一阶段的战任务，解放了漳州中的闽南陆，共歼国民党军1.7万余人，厦门、金门国民党军暴露在解放军的攻击面前。28日，28军主力达厦门东北区石井集结。
9月26日，叶飞在泉州战议提了金厦同取、先金厦、先厦金3方案。古往今，军一直是金厦并称。因两岛齿相依，相邻并列，扼台湾与陆海通冲，紧紧拱卫闽南陆，是东南海防。
3方案一一了分析。
一是金厦同取。其利端是造国民党军指挥及兵力火力的分散，使其顾此失彼，求全歼；但征集船十分困难。
二是先金厦。形厦门的完全包围，暴露厦门的侧背防御弱点，便我乘隙攻击；但厦门国民党军已有逃跑迹象，先攻金门，厦门敌极有逃跑达不全歼目的。
三是先厦金。其利端是面敌清楚，距离近，便准备，攻击易奏效；但一旦厦门攻，金门敌逃跑，同达不全歼。
与者点头称是。是决定由28军担任攻取金门，29军31军担任攻取厦门的任务。
，叶飞立即深入部队，却现29军有3团的船，31军29军差不，28军有1团的船。情况，叶飞的双眉紧紧皱在一。不待，怎办？他经一番深思，决定改变原方案，采取先厦金的三方案。10月7日，他将一方案报告野司。野司首长复电：“考虑条件比较熟，则同攻击；否则是否一部兵力（主加强炮火封锁敌船阻援与载逃）牵制金门敌，此案比较妥……请你依实情办理，行决定。”
叶飞分析说：“国民党军虽在拼命顽强固守，但显露恐慌动摇理。汤恩伯总部方厦门补给司令部移金门，巡防处从厦门移金门总部，军级指挥机关移军舰办公，技术兵团等撤往台湾。迹象表明，汤恩伯口硬却虚，并无坚守的信决。”他挥动着拳头，坚定说：“我应趁敌士气瓦解际，一鼓气，同进攻金厦两岛。”
叶飞达战命令：31军及29军攻取厦门。28军攻取、嶝岛，并攻金门准备。待攻占厦门，再打金门。