了国务院的门，徐树铮的霸风丝毫未变。按照责任内阁制，总理总揽一切军国计，但是其决定总统命令的形式表，就是说，必须经总统府盖印手续，否则无法生效。在段祺瑞、徐树铮的目中，总统就是一架盖印机器，有命令内容置喙的余。
问题是，黎元洪本人不认，他掌握总统府印信一件。总统府的监印官叫辑瑞室主任，了表示慎重，黎元洪特命他的亲、长子的岳父唐某担任。
一般情况，段祺瑞不己拿着公文盖印，主由徐树铮负责。有一次，徐树铮拿着一命令总统府请唐某盖印。唐某全文了一遍，嘴习惯嘟囔：“的措词合适吗？恐怕斟酌斟酌吧……”
“老兄，请放，你管盖你的印了。责任内阁制嘛，一切由总理负责。”徐树铮不等他说完，就很不客气说，“你说他（指段祺瑞）的命令不妥，明白的人知你在文字推敲，力求工整，不知的人，不是说你胡乱干涉国政吗？”
徐树铮说番话是项庄舞剑，意在沛公，明着说唐某，其实是暗示黎元洪不应该在盖印环节加塞。唐某听，仍嗫嚅着说：“儿总统找……”
徐树铮见他不知趣，便故意半玩笑半认真说：“总统是老兄不放，那就请他己盖印了！”
唐某无法，在命令盖了“总统印”。徐树铮回国务院，一见段祺瑞及秘书就不由放声笑，说：“我今给菩萨念了一遍咒。”
从被徐树铮教训了一顿，唐某尝厉害，真的不敢再管印的了。黎元洪见状，便印信带己办公的方，给任总统府秘书长的张国淦保管，徐树铮盖印，就必须直接找黎元洪办理。
管印的换了总统，徐树铮一不买账。有一次，黎元洪了命令，觉有些方不妥，就拿笔准备在文字方面稍修改，不料徐树铮立刻拉着他执笔的手说：“总统，万不随便改……”
尽管徐树铮颜悦色，的似乎是恳求语气，是黎元洪是被气半说不话。
徐树铮的分处在，总统国务院有所指示，国务院秘书长照例应在国务议进行报告，徐树铮则是愿意报告就说两句，不愿报告就撂一边，黎元洪完全说一。黎元洪办的是此，他愿办就办，不愿办就高高挂。
某日，国务院在一内更调了山西省的三厅长。徐树铮拿着相关命令盖印，黎元洪见了问问原因，徐树铮却不耐烦说：“总统管在页年月盖印，何必管前面写什，我忙着呢！”黎元洪被弄十分难堪。
类情了，即便黎元洪是有名的泥菩萨忍受不了，他气愤说：“现在哪是责任内阁制，简直是责任院秘书长制。”
在徐树铮的影响，国务院的许办人员知有段总理不知有黎总统，就连内阁中的一般办人员敢挖苦顶撞黎元洪。
初吴光新知徐树铮任国务院秘书长，就曾毓隽断言：“一，国务院从此，你若不信，拭目待。”今果弄了一的局面，幸亏张国淦一直从中周旋调停，冲突才有进一步激化。
黎元洪徐树铮的矛盾，其实就是他段祺瑞间的矛盾。那一年北京，袁世凯虽不给黎元洪任何政治实权，是面，平礼尚往，嘘寒问暖，码他佛一供着。
袁世凯的一套，段祺瑞不，他人一向非常严肃，无论谁，是板着面孔，很少露笑容，更不说什玩笑话。跟黎元洪在一是此，不故意装推重尊崇的子，让黎元洪内很不舒服。
在段祺瑞，总统职位本非他姓段的莫属，是由国内外的压力，才黎元洪扶了“马”，扶黎“马”，他是很认真很花力气的。是有与段祺瑞关系不睦的人了挑拨离间，却向黎府吹风，说：“我在项城的灵前讨论总统问题，老段反黄陂（黎元洪）继任，是东海（徐世昌）竭力促的。”
黎元洪听信真，段祺瑞更加不满，现在再加一徐树铮，那股怨气已了难化解的程度。
限身力量薄弱，黎元洪虽满腹怨尤，但在部分间忍气吞声。他敢段祺瑞唱台戏，乃是现国议员倾向己的。